[发明专利]一种采用软件自动识别的细胞计数方法有效
申请号: | 201711314308.3 | 申请日: | 2017-12-12 |
公开(公告)号: | CN108171683B | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | 何加铭 | 申请(专利权)人: | 杭州键一生物科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/66;G06T5/00;G06T5/40 |
代理公司: | 宁波甬致专利代理有限公司 33228 | 代理人: | 潘李亮 |
地址: | 311225 浙江省杭州市大*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明涉及细胞技术领域,尤其涉及一种采用软件自动识别的细胞计数方法,它包括以下步骤:通过采集图像;图像增强;均值偏移分割,然后进行漫水填充;进行并查集算法进行统计;进行graph‑based算法进行处理;进行初步筛选;得到支持向量机模型;通过支持向量机模型进行训练;进行二次筛选;最后得到图像中细胞的数量。这种计数方法计数准确性较高且计数方便。 | ||
搜索关键词: | 一种 采用 软件 自动识别 细胞 计数 方法 | ||
S1、采集图像;
S2、对采集到的图像进行图像增强;
S3、将增强后的图像进行均值偏移分割,然后进行漫水填充;
S4、将填充后的图像使用并查集算法进行统计,得到每个连通块的坐标,然后筛选出内部像素点数量大于X的连通块,将筛选出来的连通块的坐标映射到步骤S2中增强后的图像上;
S5、将映射完后的图像进行graph‑based算法进行处理,并再次用并查集算法进行统计得到每个连通块的坐标;
S6、计算每个连通块的自身尺寸,然后根据细胞的实际大小进行初步筛选;
S7、对初步筛选完的图像中每一个连通块求Hu不变矩7个特征,然后组成n*7向量作为数据,进行k‑means聚类,然后得到支持向量机模型;
S8、将步骤S6初步筛选完后得到的图像通过步骤S7得到的支持向量机模型进行训练;
S9、将步骤S8得到的图像剔除干扰颜色区域,然后再进行二次筛选;
S10、求出二次筛选后图像中剩余的连通块数量,然后即得到图像中细胞的数量。
2.根据权利要求1所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于:步骤S2图像增强主要采用平滑加拉普拉斯算子方法与直方图衡化方法。3.根据权利要求1所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于,步骤S6主要包括以下步骤:S61、去除连通块中尺寸较大或者较小的连通块;
S62、去除连通块周长与尺寸比例不和谐的连通块。
4.根据权利要求3所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于,步骤S6还包括以下步骤:S63、去除连通块尺寸与外接矩形框比例不和谐的连通块;
S64、去除连通块外接矩形框长和宽比例不和谐的连通块。
5.根据权利要求1所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于:步骤S9中的二次筛选是指去除连通块周长与尺寸比例不和谐的区域。6.根据权利要求1所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于,步骤S10具体包括以下步骤:S101、求出二次筛选后图像中剩余的连通块的质心;
S102、计算质心之间的相互距离,然后去除质心距离小于Y的两个质心的其中一个;
S103、计算剩余质心的数量,即得到图像中细胞的数量。
7.根据权利要求6所述的一种采用软件自动识别的细胞计数方法,其特征在于,步骤S102具体包括以下步骤:S1021、将所有质心设置成一个质心合集,然后选择其中一个质心作为基础质心,然后将其余质心均作为比对质心;
S1022、选择其中一个比对质心,然后计算基础质心与选择的比对质心之间的距离;
S1023、若计算出来的质心距离小于Y,则将这个比对质心从质心合集中删除,然后继续选择其他比对质心,重复步骤S1023,直到所有的比对质心均已经选择完毕,则跳转到下一步;若计算出来的质心距离大于Y,则继续选择其他比对质心,重复步骤S1023,直到所有的比对质心均已经选择完毕,则跳转到下一步;
S1024、从质心合集中再选择一个质心作为基础质心,将质心合集内的其余质心均作为比对质心,然后重步骤S1022到步骤S1023,直到质心合集内剩余的质心均已经做过基础质心了。
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