[发明专利]一种肝癌生物学过程中转录组和蛋白组学的生物信息分析方法在审
| 申请号： | 201711168734.0 | 申请日： | 2017-11-22 |
| 公开（公告）号： | CN107918724A | 公开（公告）日： | 2018-04-17 |
| 发明（设计）人： | 于思创;王海云 | 申请（专利权）人： | 南宁科城汇信息科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18;G06F19/20;G06F19/24 |
| 代理公司： | 南宁指北针知识产权代理事务所(特殊普通合伙)45120 | 代理人： | 于勤,林培 |
| 地址： | 530022 广西壮族自治区南*** | 国省代码： | 广西;45 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种肝癌生物学过程中转录组和蛋白组学的生物信息分析方法，①基本分析Intersize长度检验，比对信息统计，随机性实验检验图，数据的覆盖度、深度统计，②高级分析基因优化，新的外显子，3'、5'UTR区识别，可变剪接，保留的内含子，跳过的外显子，可变第一外显子、可变最后外显子，可变剪接第一外显子、可变剪接最后外显子，互斥外显子，新基因或新转录本，预测新转录本的注释，进行表达量分析，差异表达分析，差异表达聚类分析，差异表达基因的功能注释分析GO功能注释富集分析，本发明采用临床样本对其进行定位定量的表达验证，寻找其与临床相关性的证据，评价临床价值，为肝癌发病学和肝癌机制研究提供新的线索。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 肝癌 生物学 过程 转录 蛋白组 生物 信息 分析 方法 | ||
【主权项】：
一种肝癌生物学过程中转录组和蛋白组学的生物信息分析方法，其特征在于：由以下步骤组成：①基本分析：Intersize长度检验；比对信息统计；随机性实验检验图；数据的覆盖度、深度统计；②高级分析：基因优化；. 新的外显子；. 3'、5'UTR区识别；可变剪接；. 保留的内含子；. 跳过的外显子；. 可变第一外显子、可变最后外显子；. 可变剪接第一外显子、可变剪接最后外显子；. 互斥外显子；新基因或新转录本；预测新转录本的注释；进行表达量分析；差异表达分析；差异表达聚类分析；差异表达基因的功能注释分析(两个或以上样品)：GO功能注释富集分析；Kegg Pathway功能富集分析，NR、swissprot、COG功能注释分析。
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