[发明专利]一种鉴别两种多鳞鱚的微型DNA条形码技术在审
申请号: | 201711019009.7 | 申请日: | 2017-10-26 |
公开(公告)号: | CN108165636A | 公开(公告)日: | 2018-06-15 |
发明(设计)人: | 高天翔;陈治;谢尔·可汗;杨天燕;张秀梅 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316000 浙江省舟山市普陀海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了一种鉴别两种多鳞鱚的微型DNA条形码技术,该技术包括以下步骤:提取Sillago panhwari与印度鱚DNA;利用DNA条形码引物对两种鱼的DNA模板进行PCR扩增得DNA条形码序列;将扩增产物进行纯化、测序,比对测序结果。有益效果为:本发明通过比对扩增得到的DNA条形码序列来鉴别Sillago panhwari和印度鱚,序列存在12个碱基的差异,表现为8个颠换,1个转换,3个插入/缺失,特征明显,能够准确高效地鉴别巴林多鳞鱚隐存种和多鳞鱚;该鉴别方法简单,结果稳定,可重复性强,扩增结果一致。 1 | ||
搜索关键词: | 鉴别 比对 测序 扩增 可重复性 扩增产物 颠换 碱基 转换 表现 | ||
MIFISH‑U‑F:5’‑GTCGGTAAAACTCGTGCCAGC‑3’;
MIFISH‑U‑R:5’‑CATAGTGGGGTATCTAATCCCAGTTTG‑3’。
3. 根据权利要求1所述的一种鉴别两种多鳞鱚的微型DNA条形码技术,其特征在于:所述PCR扩增的反应体系组成为:超纯水17.5ul、10×buffer 2.5ul、dNTPs 2ul、rTaq 0.15ul、DNA模板1ul、Primer各1ul。4.根据权利要求1所述的一种鉴别两种多鳞鱚的微型DNA条形码技术,其特征在于:所述PCR扩增程序为:94℃预变性2min,然后94℃变性20s,50℃退火20s,72℃延伸20s,共进行35个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存∞。5. 根据权利要求1所述的一种鉴别两种多鳞鱚的微型DNA条形码技术,其特征在于:所述Sillago panhwari的DNA条形码序列为:CACCGCGGTTATACGAGAGGCCCAAGTTGATAGACATCGGCGTAAAGCGTGGTTAAGAGTACACTTACTAAAGCCGAATACCCCCCCCAGCTGTTATACGCCAGCGGGGTCTTAGAAGCACAATAACGAAAGTAGCTTTATGATACCTGAACCCACGAAAGCTAAGGCA;
所述印度鱚的DNA条形码序列为:
CACCGCGGTTATACGAGAGGCCCAAGTTGATAGACATCGGCGTAAAGCGTGGTTAAGGACTCAACAACTAAAGCCGAATACCCCCCCAGCTGTTATACGCCCGCGGGGAATTAGAAGCACAATCACGAAAGTAGCTTTATTATACCTGAACCCACGAAAGCTAAGGCA。
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