[发明专利]一种基于多组学数据整合的植物全基因组多层次生物网络重建方法

摘要

本发明公开了一种基于多组学数据整合的植物全基因组多层次生物网络重建方法，该方法通过整合水稻基因调控网络、蛋白质互作网络和代谢网络，完成了水稻多层次调控网络的构建，同时通过整合水稻不同组织生长过程中的表达谱数据，根据建好的水稻多层次调控网络，进行特定组织多层次基因调控网络的构建，从而构建出第一个目前数据水平上最为完整的高质量的水稻基因组尺度的多层次生物网络，为植物多层次生物网络的构建提供一种新的思路，构建的水稻多层次基因调控网络数据库实现了多层次调控网络的3D可视化。

主权项

一种基于多组学数据整合的植物全基因组多层次生物网络重建方法，包括如下步骤：(1)收集整合植物多组学数据；(2)基于所述植物多组学数据通过整合和修正构建水稻基因组尺度上的代谢网络模型；(3)基于所述代谢网络模型通过整合构建水稻多层次基因调控网络；(4)基于所述调控网络开发出水稻多层次基因调控网络数据库RiceNetDB以及该调控网络的3D可视化平台。