[发明专利]一种DNA突变及甲基化状况检测方法在审
| 申请号: | 201710909013.4 | 申请日: | 2017-09-29 |
| 公开(公告)号: | CN109593839A | 公开(公告)日: | 2019-04-09 |
| 发明(设计)人: | 冯延叶;王永亭 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/6806 |
| 代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 王正君;陆凤 |
| 地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | 本发明提供了一种DNA突变及甲基化状况检测方法,具体地,本发明提供了一种可同时检测DNA突变和DNA甲基化状态信息的方法。本发明方法包括了特定的经优化的修复步骤和扩增步骤,并使用特定的接头序列,从而可以同时准确、快速、高灵敏度地检测样品中的DNA突变和甲基化的位点,非常具有应用前景。 | ||
| 搜索关键词: | 甲基化状况 检测 高灵敏度 检测样品 接头序列 甲基化 扩增 位点 修复 应用 优化 | ||
【主权项】:
1.一种同时检测DNA突变和甲基化位点的方法,其特征在于,包括步骤:(a)提供一待测样本;(b)对所述待测样本进行第一修复,从而获得经第一修复的待测样本;(c)对所述经第一修复的待测样本进行第二修复,从而获得经第二修复的待测样本;(d)对所述经第二修复的待测样本,用接头序列进行接头连接;(e)对接头连接的待测样本进行文库修复,从而获得文库;(f)对所述文库进行预扩增,从而获得预扩增产物;(g)对所述预扩增产物进行碱基转换处理,从而获得转换产物;(h)对所述转换产物进行PCR富集扩增,从而获得转换产物的扩增产物;(i)对所述转换产物的扩增产物进行测序;以及(j)分析所述的测序数据,从而获得检测结果,所述检测结果包括:DNA突变和甲基化位点。
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