[发明专利]一种基于低秩矩阵填充的药物重定位方法

摘要

本发明公开了一种基于低秩矩阵填充的药物重定位方法。本发明首先通过集成药物和疾病相关数据，构建了药物‑疾病异构网络，矩阵中的元素包括药物对、疾病对、已知药物‑疾病对和未知药物‑疾病对。然后利用快速矩阵填充算法填充该矩阵，为未知药物‑疾病对赋予预测值，根据所填充的预测值，为所有的药物预测新适应症。本发明简单有效，通过与其他方法比较，及在多个数据集上测试表明，该发明在药物重定位方面具有较好的预测性能。

主权项

一种基于低秩矩阵填充的药物重定位方法，其特征在于，包括以下步骤：1)利用已知的疾病数据、药物数据和疾病‑药物关联数据，构建疾病‑药物异构网络；2)基于验证的方法确定填充矩阵的最优秩；基于所选定的最优秩，采用奇异值阈值算法实现药物‑疾病异构网络的邻接矩阵的填充；3)基于填充的矩阵，预测潜在的、新的药物‑疾病关联：从填充的矩阵中抽取药物‑疾病网络所对应的邻接矩阵，该矩阵中的每个元素对应一对药物‑疾病的关联值，关联值越大，表明这对药物与疾病之间存在关联的可能性越大；对于特定药物，根据所填充的关联值排序候选疾病，从而完成新的药物‑疾病关联的识别。