[发明专利]一种小麦品种遗传组成图谱的绘制方法

摘要

本发明公开了一种小麦品种遗传组成图谱的绘制方法，涉及农业科技、分子标记技术领域。该绘制方法，针对高通量小麦芯片(如660K、90K芯片等)分析获得的数万至数十万的SNP标记，对有明确系谱关系的小麦育种亲本和子代的遗传信息传递和分布，进行图像展示，从而达到直观展现育种亲本遗传信息在子代基因组的分布模式，包括数量(是指通过图谱可以看出大致的遗传信息传递，当父母本间贡献差异较大时，可以比较明显的看出母本或是父本贡献的遗传信息的多少)和在染色体的分布。有利于从基因组水平更好的理解小麦育种对基因组产生的影响，并为后续的小麦育种提供基因组信息参考。

主权项

1.一种小麦品种遗传组成图谱的绘制方法，其特征在于，包括如下步骤：/nS1，选择要分析的小麦育种亲本和子代，其中，亲本和子代有明确的系谱关系；/nS2，获取小麦育种亲本和子代的高通量SNP标记位点；/nS3，将得到的高通量SNP标记位点整理成AA，AB，BB格式的SNP分型数据；/nS4，对SNP分型数据按照母本、父本、子代的类别进行整理，并将父母本及子代SNP分型数据中的缺失SNP位点剔除，分别得到用于绘制子代遗传组成图谱的母本、父本、子代的SNP分型数据；/nS5，用于绘制子代遗传组成图谱的小麦基因组中有21条染色体，分别用“1A、1B、1D……7A、7B、7D”来表示，分别将S4中得到的用于绘制子代遗传组成图谱的母本、父本、子代的SNP分型数据按照1A、1B、1D……7A、7B、7D的顺序排好，并将染色体内的位点按照遗传连锁距离顺序排好；/nS6，对S5中得到的母本、父本、子代的SNP分型数据形成的组合进行筛选，筛选过程中，重复的标记组合类型作为一种标记组合类型，得到所有的SNP标记组合类型；/nS7，分别定义母本、父本特有等位变异的标识颜色和父母本共有等位变异的标识颜色；/nS8，对于每一种标记组合类型，判断子代的遗传信息来自母本还是父本，或者是非亲本来源，并采用对应的颜色进行展示；/nS9，根据S8的判断，将染色体上每一个SNP位点呈现的母本、父本、子代的标记组合类型赋予相应的颜色，并将高通量SNP位点获得的高通量的颜色组合根据标记位点遗传距离的顺序进行排列，获得某一染色体上的遗传组成图谱；/nS10，对小麦基因组21条染色体逐一展示，完成小麦子代品种遗传组成图谱的绘制。/n