[发明专利]高通量测序序列的存储方法和查询方法有效
| 申请号： | 201710549780.9 | 申请日： | 2017-07-07 |
| 公开（公告）号： | CN107506618B | 公开（公告）日： | 2020-12-08 |
| 发明（设计）人： | 赵屹;卜德超;周恒 | 申请（专利权）人： | 北京中科晶云科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B50/30 | 分类号： | G16B50/30;G06F16/13;G06F16/14 |
| 代理公司： | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人： | 王勇 |
| 地址： | 100086 北京市海淀*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供一种高通量测序序列的存储方法和查询方法。该存储方法包括：获取与参考基因比对后的高通量测序序列，其中，该高通量测序序列包括每条测序序列及其起始位置、结束位置以及与参考基因的比对结果；基于预定的分层分片策略确定所述测序序列的分片索引编号，其中，所述分层分片策略包括层数、每层包含的分片数、每个分片包含的数据量、以及每层的第一个分片的索引编号；基于所确定的分片索引编号分布式存储测序序列。本发明还提供了一种对应于存储方法的查询方法。根据本发明的存储和查询方法能够增加高通量测序序列的存储和查询的效率，并且可以进一步直观快速的显示查询的测序序列。 | ||
| 搜索关键词： | 通量 序列 存储 方法 查询 | ||
【主权项】：
一种测序序列的存储方法，包括：步骤1：获取与参考基因比对后的高通量测序序列，其中，所述高通量测序序列包括每条测序序列及其起始位置、结束位置以及与参考基因的比对结果；步骤2：基于预定的分层分片策略确定所述测序序列的分片索引编号，其中，所述分层分片策略包括层数、每层包含的分片数、每个分片包含的数据量、以及每层的第一个分片的索引编号；步骤3：基于所确定的分片索引编号分布式存储所述测序序列。
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