[发明专利]幽门螺旋杆菌及其耐药基因突变检测试剂盒和检测方法

摘要

一种幽门螺旋杆菌及其耐药基因突变检测试剂盒和检测方法，特征是包括KOD DNA 聚合酶、引物HPC‑F、引物HPC‑R、特异性靶向荧光探针、阳性参考品1、阳性参考品2、阳性参考品3；阳性参考品1是以野生型幽门螺旋杆菌23S rRNA基因为模板而设计的一段线性DNA序列；阳性参考品2是以幽门螺旋杆菌23S rRNA基因2142位点有突变为模板而设计的一段线性DNA序列；阳性参考品3是以幽门螺旋杆菌23S rRNA基因2143位点有突变为模板而设计的一段线性DNA序列。本发明对幽门螺旋杆菌能够快速、准确地检测幽门螺旋杆菌、幽门螺旋杆菌23S rRNA基因以及23S rRNA上第2142或2143位点变异。

主权项

一种幽门螺旋杆菌及其耐药基因突变检测试剂盒，其特征在于：包括KOD DNA 聚合酶、引物HPC‑F、引物HPC‑R、特异性靶向荧光探针、阳性参考品1、阳性参考品2以及阳性参考品3；所述引物HPC‑F为针对幽门螺旋杆菌23S rRNA基因设计的正向引物，该正向引物的序列为5’‑GTGGAGGTGAAAATTCCTCCTACCC‑3’；所述引物HPC‑R为针对幽门螺旋杆菌23S rRNA基因设计的反向引物，该反向引物的序列为5’‑GGCTCCATAAGAGCCAAAGCCCTTAC‑3’；所述特异性靶向荧光探针是以幽门螺旋杆菌23S rRNA野生型基因组为模板设计的探针，其碱基序列为5’‑ CAAGACGGAAAGACCC ‑3’， 荧光染料为氟硼二吡咯；所述阳性参考品1是以野生型幽门螺旋杆菌23S rRNA基因为模板而设计的一段线性重组DNA序列，阳性参考品1的序列为5’‑GTCGGTTAAATACCGACCTGCATGAATGGCGTAACGAGATGGGAGCTGTCTCAACCAGAGATTCAGTGAAATTGTAGTGGAGGTGAAAATTCCTCCTACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGTGGACCTTTACTACAACTTAGCACTGCTAATGGGAATATCATGCGCAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTAAGGGCTTTGGCTCTTATGGAGCCATCCTTGAGATACCACCCTTGAT‑3’ ，其中，带有下划线的碱基从左到右分别表示野生型幽门螺旋杆菌23S rRNA基因的2142和2143位点的碱基；所述阳性参考品2是以幽门螺旋杆菌23S rRNA基因的2142位点有突变为模板而设计的一段线性重组DNA序列，阳性参考品2的序列为5’‑GTCGGTTAAATACCGACCTGCATGAATGGCGTAACGAGATGGGAGCTGTCTCAACCAGAGATTCAGTGAAATTGTAGTGGAGGTGAAAATTCCTCCTACCCGCGGCAAGACGGGAAGACCCCGTGGACCTTTACTACAACTTAGCACTGCTAATGGGAATATCATGCGCAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTAAGGGCTTTGGCTCTTATGGAGCCATCCTTGAGATACCACCCTTGAT‑3’，其中，带有下划线的碱基表示幽门螺旋杆菌23S rRNA基因的2142位点突变后的碱基；所述阳性参考品3是以幽门螺旋杆菌23S rRNA基因的2143位点有突变为模板而设计的一段线性重组DNA序列，阳性参考品3的序列为5’‑GTCGGTTAAATACCGACCTGCATGAATGGCGTAACGAGATGGGAGCTGTCTCAACCAGAGATTCAGTGAAATTGTAGTGGAGGTGAAAATTCCTCCTACCCGCGGCAAGACGGAGAGACCCCGTGGACCTTTACTACAACTTAGCACTGCTAATGGGAATATCATGCGCAGGATAGGTGGGAGGCTTTGAAGTAAGGGCTTTGGCTCTTATGGAGCCATCCTTGAGATACCACCCTTGAT‑3’，其中，带有下划线的碱基表示幽门螺旋杆菌23S rRNA基因的2143位点突变后的碱基。