[发明专利]分型方法和装置有效
申请号: | 201680067128.7 | 申请日: | 2016-02-18 |
公开(公告)号: | CN108350498B | 公开(公告)日: | 2021-10-19 |
发明(设计)人: | 章元伟;张涛;曹红志 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 518083 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开一种分型方法,包括步骤:获取测序数据;比对参考基因组至基准序列组,获得型别集合;比对测序数据至参考序列组,获得比对结果;将比对结果转化为相对于基准序列的转化的比对结果;对比对上同一基准序列的读段进行组装,获得单体型;确定单体型支持的型别;对型别进行分组,获得第一和第二候选型别组;分别对第一和第二候选型别组中的型别进行筛选,以确定出主要和次要型别;基于支持主要和次要型别的读段数目的差异,判定目标区域的基因型。该分型方法适用于任何区域的基因分型,特别适用于高度多态性区域的分型,例如对HLA‑DRB3、4和/或5的分型。 | ||
搜索关键词: | 方法 装置 | ||
【主权项】:
PCT国内申请,权利要求书已公开。
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