[发明专利]评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法有效
| 申请号： | 201610912539.3 | 申请日： | 2016-10-19 |
| 公开（公告）号： | CN106709231B | 公开（公告）日： | 2019-03-26 |
| 发明（设计）人： | 王忠;王朋倩 | 申请（专利权）人： | 王忠;王朋倩 |
| 主分类号： | G16C20/50 | 分类号： | G16C20/50 |
| 代理公司： | 北京瑞恒信达知识产权代理事务所(普通合伙) 11382 | 代理人： | 曹津燕;张伟 |
| 地址： | 100700 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供一种针对生物分子的复杂网络，如蛋白质相互作用网络、基因表达调控网络、生物代谢网络、表观遗传网络、表型网络、信号转导网络，评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法。主要步骤如下：针对药物干预前后的生物分子网络分别进行模块的识别；基于识别的两组模块，对模块间直接和间接联系参数进行计算、筛选、整合，获得每组模块中任意两个模块的模块间协调系数；基于模块间协调系数，构建模块网络；对比药物干预前后的模块网络拓扑参数，或识别药物干预前后的模块网络连接子，计算连接子离解率。 | ||
| 搜索关键词： | 药物干预 网络 分子网络 模块网络 评价生物 生物分子 连接子 中药物 蛋白质相互作用 基因表达调控 信号转导网络 复杂网络 构建模块 生物代谢 拓扑参数 遗传网络 表型 离解 两组 整合 协调 筛选 | ||
【主权项】：
1.一种评价生物分子网络中药物对模块间关系的影响的方法，所述方法包括以下步骤：(1)以节点数目≥3为标准，分别对于疾病相关的药物干预前的生物分子网络和药物干预后的生物分子网络进行模块的识别，以获得药物干预前的生物分子网络的一组模块和药物干预后的生物分子网络的一组模块；(2)对于步骤(1)获得的两组模块，分别获得每组模块中任意两个模块的模块间协调系数，其中所述模块间协调系数由模块间直接联系参数和模块间间接联系参数的加权求和或不加权求和得到；(3)基于步骤(2)获得的模块间协调系数，分别构建以模块为单位的模块网络，以获得药物干预前的模块网络和药物干预后的模块网络；和(4‑1)针对步骤(3)获得的两个模块网络，以一个或多个拓扑参数计算药物干预前后模块网络的拓扑结构变化；或者(4‑2)针对步骤(3)获得的两个模块网络，通过度量模块重要性的方法识别连接子，计算连接子离解率。
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