[发明专利]一种将基因信息进行二进制表示的存储方法有效
申请号: | 201610390134.8 | 申请日: | 2016-06-02 |
公开(公告)号: | CN106022006B | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 谢清禄;徐宏锴;朱军;余孟春 | 申请(专利权)人: | 广州麦仑信息科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/28 | 分类号: | G06F19/28;G06F19/26;G06F19/24 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 510665 广东省广州*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种将基因信息进行二进制表示的存储方法,所述的方法包括:根据DNA双链结构及碱基配对,由字符代表匹配的碱基对;将四种碱基对进行数值定义并用两位二进制数来表示;三个碱基对组成的碱基组以6位二进制数值和2位固定赋值组成一个8位一字节的二进制数值表示;以线性映射的方式,将64种碱基组0~63根据Y=4X、或Y=4X+1、或Y=4X+2、或Y=4X+3的公式均匀映射到0~255中,并将0~255所有数值转换为8位二进制数,以二进制字节流形式的数据信息进行存储。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因 信息 进行 二进制 表示 存储 方法 | ||
【主权项】:
1.一种将基因信息进行二进制表示的存储方法,其特征在于,所述的方法包括:根据DNA双链结构及碱基配对,由字符代表匹配的碱基对;将四种碱基对进行数值定义并用两位二进制数来表示;三个碱基对组成的碱基组以6位二进制数值和2位固定赋值组成一个8位一字节的二进制数值表示;以线性映射的方式,将64种碱基组0~63根据Y=4X、或Y=4X+1、或Y=4X+2、或Y=4X+3的公式均匀映射到0~255中,并将0~255所有数值转换为8位二进制数,以二进制字节流形式的数据信息进行存储。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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