[发明专利]一种细胞内环境下蛋白质相互作用组学的分析方法

摘要

本发明公开了一种细胞内环境下蛋白质相互作用组学的分析方法，将静电纺丝技术与生物质谱技术相结合，首先利用静电纺丝技术为MALDI质谱分析制备大量所需样品，然后使用蛋白质组学数据库对所得数据进行检索分析，明确各样品颗粒内蛋白质的组成成分，最后利用蛋白质组学数据统计分析软件对各样品颗粒内蛋白质的组成成分进行统计，明确细胞内不同种蛋白质相互作用的几率，最终为构建细胞内各生物分子间的三维相互作用图提供云数据支持。本发明方法操作简便，可实现高通量检测分析，不需要使研究物种被基因修饰，克服了一般质谱方法灵敏度低和需要基质分子促使分析对象发生离子化的缺陷。

主权项

1.一种细胞内环境下蛋白质相互作用组学的分析方法，包括步骤1，待分析蛋白样品的获取：将细胞或菌体破碎、离心、沉淀后得到待分析蛋白样品，其特征在于，还包括以下步骤：步骤2，含氟聚合物的多孔硅基底的制备：以N，N‑二甲基甲酰胺和丙酮的混合溶液作为纺丝溶剂，然后将聚偏氟乙烯溶于纺丝溶剂中得到纺丝溶液，再将纺丝溶液进行静电纺丝，以多孔硅材料为接收装置，纺丝结束后真空干燥，得到含氟聚合物的多孔硅基底；步骤3，待分析蛋白样品颗粒的制备：将聚乳酸‑羟基乙酸共聚物溶于有机溶剂中配制纺丝溶剂，将步骤1得到的待分析蛋白样品溶于纺丝溶剂中得到纺丝溶液，采用静电纺丝的方法，以步骤2制备的含氟聚合物的多孔硅基底为接收装置，得到铺排于含氟聚合物的多孔硅材料基底的待分析蛋白样品颗粒；步骤4，MALDI质谱分析：对步骤3制备的待分析蛋白样品颗粒进行MALDI质谱分析，得到各样品颗粒的质谱图数据；步骤5，将各样品颗粒获得的质谱图数据在蛋白质组学数据库中进行检索，确定样品颗粒内的蛋白质组成成分；步骤6，统计分析各蛋白质相互作用的几率：利用蛋白质组学统计软件对步骤5得到的样品颗粒内的蛋白质组成成分进行统计，确定细胞内不同种蛋白质相互作用的几率。