[发明专利]减小基因组覆盖测量中的偏差

摘要

本发明提供了使用流控技术对分子进行检测和定量的方法。在某些实施方式中，所述方法包括最小化或消除由标记物密度引起的偏差，或者最小化或消除由标记物密度之外的因素引起的偏差。在某些实施方式中，所述方法包括遗传结构变异的自动鉴定。在某些实施方式中，所述方法包括分析血液以检测来自于胎儿或肿瘤的循环DNA或细胞的存在。

主权项

一种表征样品的方法，所述方法包括：使用第一标记物标记多个样品分子，其中所述样品分子包含基因组或基因组片段；通过流体通道转移多个标记的样品分子；检测来自于所述标记的样品分子的信号的计数，以便确定所述基因组或基因组片段特征性的模式或多个模式；将来自于所述标记的样品分子的信号与参比物相关联，以确定所述样品分子对所述基因组或基因组片段的一个或多个区域的覆盖；将所述信号的覆盖深度针对不包含性染色体或其片段的所述基因组或基因组片段的区域所对应的信号的覆盖深度的子集进行缩放，由此提供缩放的覆盖深度；并且通过下述一者、两者或三者对所述缩放的覆盖深度进行归一化：所述多个标记的样品分子的特征性分子长度；或所述参比物的多个区间中每个区间的特征性标记物数目，其中所述参比物包含多个区间；或每个分子的特征性标记物数目或每个分子的预定长度区段内的特征性标记物数目，由此产生所述样品分子的拷贝数曲线，其中在所述拷贝数曲线中由标记物密度引起的偏差和由标记物密度之外的因素引起的偏差被最小化或消除。