[发明专利]一种细胞基因翻译过程建模方法有效
| 申请号： | 201510933552.2 | 申请日： | 2015-12-15 |
| 公开（公告）号： | CN106897578B | 公开（公告）日： | 2020-02-14 |
| 发明（设计）人： | 李国辉;张鼎林;赵然 | 申请（专利权）人： | 中国科学院大连化学物理研究所 |
| 主分类号： | G16B25/00 | 分类号： | G16B25/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 21002 沈阳科苑专利商标代理有限公司 | 代理人： | 许宗富 |
| 地址： | 116023 *** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种细胞基因翻译过程建模方法，包括以下步骤：根据物种的实验数据得到每一个基因在每一个离散时间点该基因是否表达；查询每个离散时间点的基因，如果基因表达，则初始化；否则不进行初始化；通过各时间点上各基因对应的mRNA拷贝数量与前一个时间点上mRNA数量对比得到各种mRNA中初始化的数量；计算mRNA分子的总初始化速度；计算核糖体分子在对应mRNA上的总延伸速度；根据总初始化速度和总延伸速度得到事件的概率；根据事件概率的权重，随机选择一个事件；更新各种分子的状态。本发明采用基于完全不对称简单排斥过程的原理，同时考虑基因的表达动态变化，使得翻译过程呈现出时间序列特征，更接近细胞发育的本质，适合研究细胞动态发育性质。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 细胞 基因 翻译 过程 建模 方法 | ||
【主权项】：
1.一种细胞基因翻译过程建模方法，其特征在于包括以下步骤：/n1）根据物种的实验数据确定每一个基因在每一个离散时间点是否表达；/n2）查询每个离散时间点的基因，如果基因表达，则初始化；否则不进行初始化；/n3）通过各时间点上各基因对应的mRNA拷贝数量与前一个时间点上mRNA数量对比得到各种mRNA中初始化的数量；/n4）计算mRNA分子的总初始化速度；计算核糖体分子在对应mRNA上的总延伸速度；根据总初始化速度和总延伸速度得到事件的概率；/n计算核糖体在mRNA上的总延伸速度通过以下公式/n
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