[发明专利]一种单分子基因测序方法与装置在审

专利信息
申请号: 201510880578.5 申请日: 2015-12-05
公开(公告)号: CN106399463A 公开(公告)日: 2017-02-15
发明(设计)人: 谢庆蓉 申请(专利权)人: 南京瑞派宁信息科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12M1/36;C12M1/34
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 211800 江苏省南京*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 一种单分子基因测序方法,其包括步骤在碳化硅衬底上生长散列的量子点颗粒;引导被测DNA分子进入间隙;由单电子电极阵列获取石墨烯的电子分布,通过快电子学输出给计算机;从单电子电极阵列输出的高速信号中重建DNA分子的时间和蜿蜒轨迹信息;获取系统响应矩阵;反演系统响应矩阵获得带有次序的核苷酸种类组成的向量。一种单分子基因测序装置,其中包括量子点薄膜间隙模块、DNA分子运动控制模块、单电子读出模块、系统响应矩阵计算模块、DNA序列估计模块。通过采用本发明的单分子基因测序方法与装置,能有效提高探测的测序精度,减少测序时间,避免基因扩增带来的偏向性误差,特别适合于手持终端和实时性要求高的应用场合。
搜索关键词: 一种 分子 基因 方法 装置
【主权项】:
一种单分子基因测序方法,其特征在于包括步骤:S1:在碳化硅衬底上生长散列的量子点颗粒,并用扫描电子显微镜对每个量子点进行定位,定位后,附上石墨烯薄膜,并在石墨烯薄膜上外延单电子电极阵列;S2:采用电磁导引和微流控技术,引导被测DNA分子进入石墨烯薄膜和碳化硅衬底的间隙;S3:DNA分子在带有量子点的薄膜间隙中游动时,不断地扭曲量子点附近的电子云结构,该电子云的涨落进一步影响石墨烯的电子分布情况,单电子电极阵列获取石墨烯的电子分布,通过快电子学输出给计算机;S4:从单电子电极阵列输出的高速信号中重建DNA分子的时间和蜿蜒轨迹信息;S5:采用已知的DNA片段测试电极阵列的系统响应矩阵,系统响应矩阵的精度足以分清四种核苷酸对电极不同的影响;S6:以轨迹附近的单电子电极的电流大小组成的向量为输出,通过反演这个系统响应矩阵,计算带有次序的核苷酸种类组成的向量。
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