[发明专利]一种开发沙冬青植物基因组简单重复序列分子标记的方法有效
| 申请号： | 201510875507.6 | 申请日： | 2015-12-02 |
| 公开（公告）号： | CN106282330B | 公开（公告）日： | 2019-09-06 |
| 发明（设计）人： | 何军贤;冯磊 | 申请（专利权）人： | 香港中文大学深圳研究院 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895 |
| 代理公司： | 深圳新创友知识产权代理有限公司 44223 | 代理人： | 江耀纯 |
| 地址： | 518057 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及一种开发沙冬青植物基因组简单重复序列SSRs分子标记的方法，包括如下步骤：(1)对采样自第一产地的物种样品的基因组DNA建立初级测序文库，进行高通量测序，获得Short Reads(短序列)测序数据；(2)对测序下机的Reads过滤之后进行序列组装得到Contigs；(3)对Contigs序列进行SSRs识别；(4)将上述SSRs在来自第二产地的同一物种的Unigene序列中进行验证，筛选到具有多态性的SSRs。本发明是一种高通量发现SSRs分子标记的方法，可以应用在该物种植物的遗传图谱构建、QTL定位和遗传多样性分析等研究中。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 开发 冬青 植物 基因组 简单 重复 序列 分子 标记 方法 | ||
【主权项】：
1.一种开发沙冬青植物基因组简单重复序列分子标记的方法，其特征在于包括下列步骤：S1、来自第一产地的蒙古沙冬青的基因组测序：对采样自第一产地的物种样品的基因组DNA建立初级测序文库，构建好基因组文库之后，使用测序仪进行高通量测序，获得Short Reads短序列测序数据；S2、对测序下机的基因组测序数据进行过滤，过滤之后进行序列组装得到Contigs；S3、SSRs的识别：对上述Contigs序列中的SSRs序列进行识别；S4、利用NCBI公开的来自第二产地的蒙古沙冬青的转录组测序数据；S5、进行SSRs的验证，通过上述两个产地的同一物种的SSRs相互比较，即：将上述SSRs在来自第二产地的蒙古沙冬青的Unigene序列中进行验证，筛选具有多态性的SSRs；20对所述具有多态性的SSRs如下表所示：![]()
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于香港中文大学深圳研究院，未经香港中文大学深圳研究院许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201510875507.6/，转载请声明来源钻瓜专利网。
