[发明专利]DNA自动测序中小概率序列判读错误的人工纠错方法在审

专利信息
申请号: 201510859188.X 申请日: 2015-11-18
公开(公告)号: CN105787293A 公开(公告)日: 2016-07-20
发明(设计)人: 唐伯平;冯越;周春霖;张代臻;刘秋宁;张华彬;李超峰;宣富君;姜森颢;葛宝明;崔军;杨丽 申请(专利权)人: 盐城师范学院
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 224051 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供一种DNA自动测序中小概率序列判读错误的人工纠错方法,以便能够纠正自动测序结果判读过程中容易出现的几种错误,这些差错一般是由电脑测序软件在判读或打印时发生的误差所致,人工纠错方法的流程包括以下步骤:(1)人工图文对比、(2)正向判读序列、(3)存储正向判读结果、(4)反向读写序列、(5)对比正反向结果、(6)人工修正错误、(7)重复两次步骤、(8)打印最终结果,本发明由于采用上述多重纠错方法,其优点是可以避免由计算机测序软件在判读或打印时发生的误差,以便能够获得更为准确和可信的DNA序列,这对DNA克隆、基因重组、基因表达和分子进化等分子生物学研究都具有十分重要的意义。
搜索关键词: dna 自动 中小 概率 序列 判读 错误 人工 纠错 方法
【主权项】:
一种DNA自动测序中小概率序列判读错误的人工纠错方法,其特征在于:所述方法的流程包括以下步骤:(1)人工图文对比:先人工核对由DNA序列测试仪自动测试的并由电脑测序软件判读和打印的图文DNA序列电泳图,查看图文DNA序列电泳图中的文字部分和峰形图之间的对应关系,如果没有误差,就执行下一步骤;如果有误差就以峰形图为准,然后再执行下一步骤;(2)正向判读序列:对DNA序列测试仪生成的测序报告按正向进行人工判读DNA序列;(3)存储正向判读结果:将上述步骤(2)的DNA序列判读结果存储到计算机中,作为对比文件一;(4)反向读写序列:对DNA序列测试仪生成的测序报告按反向读写DNA序列,并将其结果翻译成反向读写序列的互补序列,存储到计算机中,作为对比文件二;(5)对比正反向结果:将上述步骤(3)的对比文件一和步骤(4)的对比文件二用计算机软件进行比对,看两者的DNA序列判读结果是否有误差;若没有误差,就执行步骤(7);若有误差,就执行下一步骤;(6)人工修正错误:如果正向判读的对比文件一与反向读写序列之互补序列的对比文件二两者之间的DNA序列判读结果有误差,就必须对出错的地方作为重点进行人工核查,对错误进行纠错,直到两者的DNA序列判读结果完全一致;(7)重复两次步骤:重新按照上述步骤(1)至步骤(6)核对DNA序列两次,即一共做三次人工DNA序列核对,看三次的判读结果是否一致,如果一张序列电泳图核对三遍,其DNA序列的判读结果是一致的,基本上就可以认为此时的DNA序列判读结果是正确的,就执行下一步骤;若重复的步骤不足两次,就重新按照上述步骤(1)至步骤(6)核对DNA序列;(8)打印最终结果:打印和生成DNA序列判读的最终结果,作为DNA序列的正式报告。
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