[发明专利]将靶标富集的序列读出分配到基因组位置的方法在审
| 申请号： | 201510742430.5 | 申请日： | 2015-11-04 |
| 公开（公告）号： | CN105574360A | 公开（公告）日： | 2016-05-11 |
| 发明（设计）人： | 克里斯提安·勒·科寇;马格纳斯·伊萨克森;阿舒拓史;莱纳斯·佛斯马克 | 申请（专利权）人： | 安捷伦科技有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18 |
| 代理公司： | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人： | 李晓冬 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及将靶标富集的序列读出分配到基因组位置的方法。本文提供用于将序列读出分配到基因组位置的计算机实施方法等等，所述方法包括：a)访问含有序列读出的文件，其中所述序列读出获得自已通过与多个捕获序列杂交而被富集的核酸样品；和b)通过下述将所述序列读出分配到基因组位置：i)如果所述序列读出包含捕获序列的一个或多个子序列，则将捕获序列识别为所述序列读出的匹配；ii)使用计算机计算指示每个匹配的捕获序列和序列读出之间的序列相似性程度的评分；和iii)如果对匹配的捕获序列计算的评分高于阈值，则将序列读出分配到基因组位置。 | ||
| 搜索关键词： | 靶标 富集 序列 读出 分配 基因组 位置 方法 | ||
【主权项】：
一种用于将序列读出分配到基因组位置的计算机实施方法，所述方法包括：a)访问含序列读出的文件，其中所述序列读出获得自已通过与多个捕获序列杂交而被富集的核酸样品；和b)通过下述将所述序列读出分配到基因组位置：i)如果序列读出包含捕获序列的一个或更多个子序列，则将捕获序列识别为序列读出的匹配；ii)使用计算机计算指示每个匹配的捕获序列和序列读出之间的序列相似性程度的评分；和iii)如果对匹配的捕获序列计算的评分高于阈值，则将序列读出分配到基因组位置。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于安捷伦科技有限公司，未经安捷伦科技有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201510742430.5/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：载体设计方法及载体设计装置
- 下一篇：临床科研数据的记录方法及系统
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
