[发明专利]一种粘连菌落的分割方法

摘要

本发明提供了一种粘连菌落的分割方法，该方法包括以下步骤：采集系列间隔h小时的菌落图像；将最后采集的菌落图像进行菌落和背景的分割，得到菌落区域，并标记菌落区域的边界；根据菌落区域的边界，依次提取在菌落图像中与菌落区域位置相同的图像区域，并将提取到的图像区域进行菌落和背景的分割，分别得到在每个菌落图像中的菌落区域；分别计算菌落区域各自包含的连通区域数，建立向量，生成连通区域矩阵数J；最后通过观察对比不同时期图像的连通区域数，分别计算得出菌落区域的菌落数，实现粘连区域内菌落的精确计数。

主权项

一种粘连菌落的分割方法，其特征在于，包括以下步骤:S1、采集菌落的图像，菌落在培养皿中培养，菌落的培养周期为kh小时，间隔h小时通过摄像装置采集菌落的图像，得到培养0小时、h小时、……、(k‑1)h小时、kh小时对应的菌落图像k+1幅，分别为I₀、I_h、……、I_(k‑1)h、I_kh，其中k为大于零的整数；S2、将所述步骤S1采集得到的所述菌落图像I_kh进行菌落和背景的分割，得到n个菌落区域，分别为Q_kh,1、Q_kh,2、……、Q_kh,n‑1、Q_kh,n，并标记图像I_kh中n个菌落区域的边界；S3、根据n个菌落区域在所述菌落图像I_kh上的边界，依次提取在k+1幅所述菌落图像中与所述菌落区域位置相同的图像区域，得到(k+1)n个图像区域，并将提取到的(k+1)n个图像区域进行菌落和背景的分割，分别得到(k+1)n个菌落区域；S4、分别计算所述步骤S3中得到的(k+1)n个菌落区域各自包含的连通区域数，建立向量S1、S2、……、S(n‑1)、Sn，生成连通区域数矩阵J；S5、根据所述步骤S4中的到的连通区域数，分别计算得出菌落区域的菌落数以及培养皿中的菌落总数。