[发明专利]一种粘连菌落的分割方法在审

专利信息
申请号: 201510732585.0 申请日: 2015-11-02
公开(公告)号: CN105335982A 公开(公告)日: 2016-02-17
发明(设计)人: 石吉勇;胡雪桃;邹小波;朱瑶迪;申婷婷;张文;黄晓玮 申请(专利权)人: 江苏大学
主分类号: G06T7/00 分类号: G06T7/00;G06K9/00
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 212013 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明提供了一种粘连菌落的分割方法,该方法包括以下步骤:采集系列间隔h小时的菌落图像;将最后采集的菌落图像进行菌落和背景的分割,得到菌落区域,并标记菌落区域的边界;根据菌落区域的边界,依次提取在菌落图像中与菌落区域位置相同的图像区域,并将提取到的图像区域进行菌落和背景的分割,分别得到在每个菌落图像中的菌落区域;分别计算菌落区域各自包含的连通区域数,建立向量,生成连通区域矩阵数J;最后通过观察对比不同时期图像的连通区域数,分别计算得出菌落区域的菌落数,实现粘连区域内菌落的精确计数。
搜索关键词: 一种 粘连 菌落 分割 方法
【主权项】:
一种粘连菌落的分割方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、采集菌落的图像,菌落在培养皿中培养,菌落的培养周期为kh小时,间隔h小时通过摄像装置采集菌落的图像,得到培养0小时、h小时、……、(k‑1)h小时、kh小时对应的菌落图像k+1幅,分别为I0、Ih、……、I(k‑1)h、Ikh,其中k为大于零的整数;S2、将所述步骤S1采集得到的所述菌落图像Ikh进行菌落和背景的分割,得到n个菌落区域,分别为Qkh,1、Qkh,2、……、Qkh,n‑1、Qkh,n,并标记图像Ikh中n个菌落区域的边界;S3、根据n个菌落区域在所述菌落图像Ikh上的边界,依次提取在k+1幅所述菌落图像中与所述菌落区域位置相同的图像区域,得到(k+1)n个图像区域,并将提取到的(k+1)n个图像区域进行菌落和背景的分割,分别得到(k+1)n个菌落区域;S4、分别计算所述步骤S3中得到的(k+1)n个菌落区域各自包含的连通区域数,建立向量S1、S2、……、S(n‑1)、Sn,生成连通区域数矩阵J;S5、根据所述步骤S4中的到的连通区域数,分别计算得出菌落区域的菌落数以及培养皿中的菌落总数。
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