[发明专利]一种GII.17型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法

摘要

本发明公开了一种GII.17型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明分别以七对引物作为扩增引物的上下游引物，以GII.17型诺如病毒的RNA为模板进行RT‑PCR扩增，分别得到扩增产物，然后对扩增产物进行核酸序列测序，然后再拼接比对，得到GII.17型诺如病毒基因组全长序列。本发明针对新出现的GII.17型诺如病毒流行基因型，根据基因组所包含的三个开放阅读框设计了“4+1+1”的分段扩增策略，根据保守区域设计相应的扩增引物，将该扩增引物应用于实际检出样本，获得了GII.17型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、成本低以及灵敏度高的特点，可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。

主权项

1.一种GII.17型诺如病毒基因组扩增引物，其特征在于，包括七对扩增引物：引物对1：II‑P1F：5′‑GTGAATGAAGATGGCGTCTAAC‑3′；II.17‑1R：5′‑GCAACTTTCTTGGCTAGCTC‑3′；引物对2：II.17‑2F：5′‑CATACATGAGGACTCTTGAC‑3′；II.17‑2R：5′‑CTTAGCAATGGCAAGCTC‑3′；引物对3：II.17‑3F：5′‑CAGGGATGAAGATGACCTCAC‑3′；II.17‑3R：5′‑GAGACCACCAAATGCTCTG‑3′；引物对4：II.17‑4F：5′‑CCTCGACAAGACAACCTCC‑3′；G2SKR：5′‑CCRCCNGCATRHCCRTTRTACAT‑3′；引物对5：NV2of2：5′‑GGAGGGCGATCGCAATC‑3′；GV132：5′‑CCRGCRAAGAAAGCTCCAGCCAT‑3′；引物对6：II.17‑6F：5′‑GCTCACTCTGGAGACTATC‑3′；II.17‑6R：5′‑TCACTAAACACGTGACTCC‑3′；引物对7：II.17‑Seq1R：5′‑ACTTCTCTCTGGCTAAGTGG‑3′；II.17‑Seq6F：5′‑CAACCAAGCAGCTGCAATC‑3′；R代表A/G，H代表A/C/T，N代表碱基A/C/T/G。