[发明专利]一种基于热力学优化的双链置换核酸探针高特异性检测单碱基改变的方法在审
| 申请号： | 201510423384.2 | 申请日： | 2015-07-17 |
| 公开（公告）号： | CN105132528A | 公开（公告）日： | 2015-12-09 |
| 发明（设计）人： | 毛红菊;武振华;张宏莲;金庆辉;赵建龙 | 申请（专利权）人： | 中国科学院上海微系统与信息技术研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人： | 黄志达 |
| 地址： | 200050 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于热力学优化的双链置换核酸探针高特异性检测单碱基改变的方法，包括：(1)针对预检测的目的序列，设计双链置换探针，并设计出相应的PCR扩增引物；通过引物扩增出目的靶序列；通过探针和引物设计，使反应1的自由能变化量接近于0，达到理论最优的特异性；(2)根据步骤(1)的设计，合成出实际的探针与引物，实现目的靶序列的高特异性检测。本发明设计出的双链置换探针进一步提高了单碱基改变检测特异性；不受检测序列长度影响；稳定性好，保存时间长；检测过程及其简单；且检测时间短；检测过程不受环境温度影响，同时不受溶液中盐离子浓度影响。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 热力学 优化 置换 核酸 探针 特异性 检测 碱基 改变 方法 | ||
【主权项】：
一种基于热力学优化的双链置换核酸探针高特异性检测单碱基改变的方法，包括：(1)针对预检测的目的序列，设计双链置换探针，并设计出相应的PCR扩增引物；通过引物扩增出目的靶序列，探针与完全互补的靶序列的反应作为反应1，所得反应产物为产物1与产物2；探针与具有单碱基改变的靶序列的反应作为反应2，所得反应产物为产物3与产物4；分别计算反应1和反应2中每一种核酸分子的标准吉布斯自由能ΔG0，并根据此计算出反应1和反应2的标准吉布斯自由能变化量ΔrG0；通过探针和引物设计，使反应1的自由能变化量接近于0，达到理论最优的特异性；(2)根据步骤(1)的设计，合成出实际的探针与引物，实现目的靶序列的高特异性检测。
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