[发明专利]EST-SSR标记引物组合及筛选方法对菜用、粮用和野生大豆遗传多样性分析和鉴定

摘要

本发明公开了一种EST-SSR标记引物组合，包括35对EST-SSR可用引物，EST-SSR标记引物组合筛选方法的步骤包括大豆EST序列中SSR位点筛选、引物设计、PCR扩增、产物毛细管电泳检测、标记筛选，并将该EST-SSR标记引物组合应用菜用大豆、粮用大豆和野生大豆遗传多样性，对菜用大豆、粮用大豆和野生大豆遗传多样性和聚类分析，有助于快速、准确地辨析区分菜用大豆、粮用大豆和野生大豆种质材料，分析其亲缘关系，为该物种的定向育种奠定基础。

主权项

一种用于菜用大豆、粮用大豆和野生大豆遗传多样性分析的EST‑SSR标记组合，其特征在于，包括35 对EST‑SSR可用引物，引物名称及序列分别为：NGMP‑031    s:5’‑ TACCAGCAACAACAGCA‑3’；a:5’‑ CATCGTAATGAGGAGGC‑3’NGMP‑069    s:5’‑ GGAAGAGGAGGAGCAGG‑3’；a:5’‑ CAAGCCAGGATGAGGTA‑3’NGMP‑080    s:5’‑ AAAGAAGACCCATCCCA‑3’；a:5’‑ GACGGTGAAGACGAAGA‑3’NGMP‑136    s:5’‑ TGCGGATTTCTCCACAAG‑3’；a:5’‑ GGTCACCTCCAACCAAGT‑3’NGMP‑148    s:5’‑ TCCTCCTGGACCTCGGTG‑3’；a:5’‑ CTTGGGCGTGAAGTGAC ‑3’NGMP‑166    s:5’‑ ACTGCCACCCCAATAAC ‑3’；a:5’‑ CCTTAGAGGAAGAGGAAACT ‑3’NGMP‑167    s:5’‑ GTAGTGTTTGGTGGCAGTG‑3’；a:5’‑ ACCTCTTGATTGGCTTCA ‑3’NGMP‑172    s:5’‑ CTCAACCAACTCACCCCAGAC ‑3’；a:5’‑ CCACTTGCCCCAATGCC ‑3’NGMP‑174    s:5’‑ TAACCCTTTACGGCTAT ‑3’；a:5’‑ ATTCCAGGTGAAGAACC ‑3’NGMP‑177    s:5’‑ AGTGGAAGATGGCGTAA‑3’；a:5’‑ CATTCATTCTGGGACAA ‑3’NGMP‑179    s:5’‑ GGACGCCATAGAGCACA‑3’；a:5’‑ ATCACCGCCTTCTTTCA ‑3’NGMP‑185    s:5’‑TGAAGAGCGGGTAACAA ‑3’；a:5’‑ TGAAGGGTAAAAGGAGG ‑3’NGMP‑187    s:5’‑GGCTTTGTTATTGGGTC ‑3’；a:5’‑ CATCACAATGGGTAGACAC ‑3’NGMP‑190    s:5’‑ GGGAATGGTTTACTGCT‑3’；a:5’‑ TCTTCACTCCTTTCTGCT ‑3’NGMP‑200    s:5’‑GTAAATACCTTTCCACCCA ‑3’；a:5’‑ TTTGACCAGCCTAGCAC ‑3’NGMP‑235    s:5’‑ GACATACATCCGAGGTTC‑3’；a:5’‑ AGGGGTAGAGTTGGAAA ‑3’NGMP‑245    s:5’‑ATTCAACAACGCAATCTCC ‑3’；a:5’‑ TCCACCCCTTTTCCCTCT ‑3’NGMP‑260    s:5’‑AAGAACGCAACACCAAAG ‑3’；a:5’‑ TCCCCATCAAAGACATCA ‑3’NGMP‑262    s:5’‑ TGACAGCGAGTGAAAGAA‑3’；a:5’‑ CAGGAGGAAGTCCAAATC ‑3’NGMP‑294    s:5’‑ ACATTAGCGTACTCTGTTTG ‑3’；a:5’‑ CGGTTTCTGAGATTTGG ‑3’NGMP‑314    s:5’‑ TTGGCTGGAATCTATCA ‑3’；a:5’‑ GTTGGGGCTAATGTGGG ‑3’NGMP‑324    s:5’‑ AGTGAACAAAAGGCAAGC ‑3’；a:5’‑ CAGATAAAGAACAACAACCC ‑3’NGMP‑332    s:5’‑ ATCCAGCGTCGGTAGTTA‑3’；a:5’‑ AGAATGAGTCCAAGAGCC ‑3’NGMP‑356    s:5’‑ GAACATTATGGCGGAAGT ‑3’；a:5’‑ TGTAGGCATCGGAGTAGG ‑3’NGMP‑359    s:5’‑ GCAAGAGCAACAGCAAT ‑3’；a:5’‑ GAAGGTCGTGGATGGAG ‑3’NGMP‑373    s:5’‑ GTGACCCTTATAGGTTTGG ‑3’；a:5’‑ ACTTCGCTGTTGGATGTA ‑3’NGMP‑397    s:5’‑ GAAACAAGACAAGCCATC ‑3’；a:5’‑ AGTTCAGACCCACAGGAG ‑3’NGMP‑399    s:5’‑ CTATGTAGACGACCTCACC ‑3’；a:5’‑ CTCATCCAAAACAACTCC ‑3’NGMP‑422    s:5’‑ AACGCAGTGGCAGACATA ‑3’；a:5’‑ GTTTCTTCCCAAGTAGCAAT ‑3’NGMP‑462    s:5’‑ GCGGTGGTGTTGAGTTGT ‑3’；a:5’‑ TTTGCGAGGAGAAGGAAT ‑3’NGMP‑492    s:5’‑ GGTCGTCCTCCTCAAAA ‑3’；a:5’‑ CAGTCCTACGGGGTTCA ‑3’NGMP‑562    s:5’‑ GCTTCCCTCCCTCCTTTG ‑3’；a:5’‑ TGTGCCCCTTATTGCCTC ‑3’NGMP‑567    s:5’‑ CACCATTCCCCTCCCATC ‑3’；a:5’‑ CTACAAGCCTCGCTCACG ‑3’NGMP‑606    s:5’‑ CAGACTCCCTCTTCATACC ‑3’；a:5’‑ GCATCCAAGGCACTAACA ‑3’NGMP‑607    s:5’‑ GCACTCGGTACAGGGAC ‑3’；a:5’‑ GGTTTTGGTTGGTTGAA‑3’。