[发明专利]一种启动子识别系统的构建方法和装置在审

专利信息
申请号: 201510166526.1 申请日: 2015-04-09
公开(公告)号: CN104834834A 公开(公告)日: 2015-08-12
发明(设计)人: 张莉;徐文轩;张召;王邦军;李凡长;杨季文 申请(专利权)人: 苏州大学张家港工业技术研究院
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22;G06F19/24
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 常亮
地址: 215600 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明的启动子识别系统的构建方法和装置,将包含多条基因序列的数据集划分为具有预设属性的第一数据子集和不具有预设属性的第二数据子集;并分别提取第一、第二数据子集的多种预设特征,所述预设特征包括基因刚性特征;之后,对特征提取所得的多个特征数据集合进行建模,得到构成启动子识别系统所需的各个子分类器模型。可见,本发明在构建人类基因启动子识别系统时,考虑了基因结构特征(如基因刚性特征),通过提取基因数据的基因刚性特征,并将提取的基因刚性特征作为训练数据进行建模,使最终的识别系统具备了结合基因结构特征识别启动子的能力,提升了系统的识别性能。
搜索关键词: 一种 启动子 识别 系统 构建 方法 装置
【主权项】:
一种启动子识别系统的构建方法,其特征在于,包括:将包含N条基因序列的数据集划分为第一数据子集和第二数据子集,所述第一数据子集具有预设属性;分别提取所述第一数据子集及所述第二数据子集中各基因序列的P种预设特征,相应得到P个第一训练特征子集及P个第二训练特征子集;所述预设特征包括基因刚性特征,N、P为大于1的自然数;分别对所述P个第一训练特征子集及所述P个第二训练特征子集进行分类建模,得到P个第一子分类器模型及P个第二分类器模型,各个所述子分类器模型构成启动子识别系统的分类识别模型。
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