[发明专利]一种基因健康网络表达测定体系的构建方法

摘要

本发明公开了一种基因健康网络表达测定体系的构建方法，包括通过应用基因表达芯片获取预先配置样本的临床实验数据，并依据转录组mRNA水平探索基因网络与健康广泛关注的性状之间的关联关系，确定并根据同机体健康相关的重要基因的芯片表达数据，以皮尔森相关性PCCs为计算依据，确定并根据基因健康网络表达的构建算法，得到基因同基因之间的相关性数据，通过皮尔森相关检验和统计学K‑均值过滤法对所获取的基因表达数据进行聚类统计，对基因之间的表达显著性进行统计过滤；在过滤结果为基因之间存在相关关系时，根据确定的相似基因的不同权值，将基因芯片的表达数据以连接边的距离为单位基因网络组成相匹配的基因健康网络。

主权项

一种基因健康网络表达测定体系的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：通过预先设置的应用基因表达芯片获取预先配置样本的临床实验数据，并依据预先配置的转录组mRNA水平探索基因网络与健康广泛关注的性状之间的关联关系，确定同机体健康相关的重要基因的芯片表达数据；基于所述芯片表达数据，以皮尔森相关性PCCs为计算依据，确定基因健康网络表达的构建算法为：$W_{\mathrm{ab}}=\underset{1}{\overset{Y}{\mathrm{\Σ}}}(w_{\mathrm{xa}}-{\mathrm{\μ}}_a)(w_{\mathrm{xb}}-{\mathrm{\μ}}_b)/\mathrm{\Δa\Δb}$其中，所述W_xa表示第X个基因在第a个样本上的表达水平值，W_xb表示第X个基因在第b个样本上的表达水平值，μ_a和Δa分别表示基因a的标准均值和标准偏差，μ_b和Δb分别表示基因b的标准均值和标准偏差；根据所述构建算法，得到基因同基因之间的相关性数据，通过预先设置的皮尔森相关检验和统计学K‑均值过滤法对所获取的基因表达数据进行聚类统计，并对基因之间的表达显著性进行统计过滤；在过滤结果为基因a和基因b存在相关关系的情况下，所述基因a和基因b之间存在连接边，根据连接边的长短确定所述基因a与基因b的之间的权值，根据所述权值确定基因a和基因b之间的相似程度；根据确定的相似基因的不同权值，将基因芯片的表达数据以连接边的距离为单位基因网络组成相匹配的基因健康网络。