[发明专利]用于检测病原体和有益微生物的核酸和方法

摘要

本发明涉及用于检测病原体和有益微生物、特别是草坪草病原性真菌和促进植物生长的根际细菌的核酸、微阵列和方法。

主权项

一组核酸用于通过杂交技术检测样品中的至少一种病原体和/或至少一种有益微生物的用途，所述一组核酸包含以下序列或由以下序列组成：(i)选自以下的序列：‑GGGTTGCTTGCTTGCGAGCTCC(SEQ ID N°1)；‑CTGGTGTTTGGACTCGCCTTAAAAC(SEQ ID N°2)；‑GCACATATTTTGCGCTTTGTATCAGG(SEQ ID N°3)；‑TCCGCCAGGGAARACCAAAACTCT(SEQ ID N°4)；‑CGGAGCGCGGGCCGTCGCG(SEQ ID N°5)；‑ACTTATACCCAAAACGTTGCCTCG(SEQ ID N°6)；‑CATTATCGAGTTTACGCTCCATAAC(SEQ ID N°7)；‑GCGCAGCTATTAGATCTACGGTG(SEQ ID N°8)；‑GCAAGGCTGGAGTATTTTATTACCCT(SEQ ID N°9)；‑CCGTGGCCTTGTTGCCACGCCC(SEQ ID N°10)；‑ATTGGGGCCTTGTTGCCACACCC(SEQ ID N°11)；‑TTTTGCGCTTTGTCCAGTTGCGG(SEQ ID N°12)；‑GATTCGTCGCCCCCCCTCCTGG(SEQ ID N°13)；‑GACCTTATTCAAACCTTTTTTTCAGTT(SEQ ID N°14)；‑GCTGTTGGGGACCGGCTCACCCG(SEQ ID N°15)；‑TGACCGTTGTCACGAGACGACTTTAT(SEQ ID N°16)；‑CTTGGTGTTGGGAGCTGCAGTCC(SEQ ID N°17)；‑CCATTGCGTAGTAGTAAAACCC(SEQ ID N°18)；‑AACGCGCTTCGTTCGGAGGCTT(SEQ ID N°19)；‑TTCAACCCTCAAGCCCCCGGGTTTG(SEQ ID N°20)；‑CGAAGTAGTGATATTCCGCATCGG(SEQ ID N°21)；‑GTTAGGGGGTCCCCTCTCCGG(SEQ ID N°22)；‑CTCGGTCTCGAGCCGCCGG(SEQ ID N°23)；‑ACACCCCATTGAACCTATTTATTTTYAA(SEQ ID N°24)；‑ACATCTCGCGCTTTGCATTCAGAA(SEQ ID N°25)；‑CGATTTTGGGGGGTGGCTAGTGC(SEQ ID N°26)；‑CTCTGAGTACGAAAAGAACCTGAAA(SEQ ID N°27)；‑TGCTGGCTCTTCTAGAGTCGGCTC(SEQ ID N°28)；‑GGCCAGACGACAGCCATAAACC(SEQ ID N°29)；‑CGCCGGTGGACTACCTAAACTCT(SEQ ID N°30)；‑CGTCGTCGCTGTTCGCAAGGAC(SEQ ID N°31)；‑TCGGGCAACGGAACCAGGCGC(SEQ ID N°32)；‑GTTGCCTCGGCGGGCACGGC(SEQ ID N°33)；‑CCAGTTATATAGGCACCCAATAAGCC(SEQ ID N°34)；‑CACCAAACCAGCTTGGGAAACCTT(SEQ ID N°35)；‑GTCACGTGGTCTTGGTTTTGAA(SEQ ID N°36)；‑CGCAACCGGGAGCCGCGGCGCGG(SEQ ID N°37)；‑TGGACTGGCTTCGGCTAGACTGG(SEQ ID N°38)；‑ACCATAGCTCAGTTGCTTGGCTTTT(SEQ ID N°39)；‑TGGCGAATGTTTGGACTTCGGTCT(SEQ ID N°40)；‑GCGCAAGCTGGGGTGGRCGAG(SEQ ID N°41)；‑GAACTTGTGTCTCTGCGGCGCG(SEQ ID N°42)；‑AACTGGTGAACCGTAGCTGTGTGGT(SEQ ID N°43)；‑CCGTACATTAAACTTGACTTTCTTCC(SEQ ID N°44)；‑GGAACTCCACCCTTGAATACACTG(SEQ ID N°45)；‑CGACCCCTTTTATAATTCACCCAAC(SEQ ID N°46)；‑CTAAAAAACCCCTCATAACCTTTTTTT(SEQ ID N°47)；‑CTCCTAAAACCCAATATCTTATTTTTAAG(SEQ ID N°48)；‑CAATACTGCCATCTTGTTTTTGAAGG(SEQ ID N°49)；‑ATACTTGCCATCTTTTTGGAAGG(SEQ ID N°50)；‑CCTAAAAACCCCCCTTATCA(SEQ ID N°51)；‑CAACCTTTTTGGAGTATTCTAATGAT(SEQ ID N°52)；‑ATACTGCCATCTTATTKAAGGGAGAC(SEQ ID N°53)；‑CAGGGCTATCCCCCTGCCAGG(SEQ ID N°54)；‑GGAGGGTTGCGCACTTTGTGCGTG(SEQ ID N°55)；‑GACGCCCTGTTTTCGGATAGGG(SEQ ID N°56)；‑TGGCGTGCGTTTGCTTGCGCTTC(SEQ ID N°57)；‑CTATACTCCGAGAACGAAAGTTTTTGG(SEQ ID N°58)；‑TAGTAGTGTGTGTRGCACGTTGTC(SEQ ID N°59)；‑TGTTTTTGTTTTGTGGAAATACGCTGTTT(SEQ ID N°60)；‑GTAGAATTTTGCTGCTCTTGGGCG(SEQ ID N°61)；‑CTGTGTAGTCAGGGATGGAATGTGC(SEQ ID N°62)；‑TGAACGCATCATGTTGCTTCGGG(SEQ ID N°63)；‑CTGGCTTTTGTTTTGGATTTGGAGGT(SEQ ID N°64)；‑CAGCGACAACCGACTCTAAGTTCA(SEQ ID N°65)；‑CTCGTGAAACACATGAAGTCTGAG(SEQ ID N°66)；‑TCGGCGCCCCAGGAGAAATCCT(SEQ ID N°67)；‑AGTCCATGTCCGCAATGGCAGG(SEQ ID N°68)；‑AACACATACCTCTCGTTACAGGGTC(SEQ ID N°69)；‑GAGCTGCTCTTCGGGGCCTTGTAT(SEQ ID N°70)；‑CTTGTATGCGCGCCAGAGAATATCA(SEQ ID N°71)；‑TATTGGGCGTCCGCGGGGGA(SEQ ID N°72)；‑GCGGAGTTCACGAGCCCTCAC(SEQ ID N°73)；‑GCGCCTTGTCTCTCGCGAGAC(SEQ ID N°74)；‑AGCTGGATCTCAGTGTTATGCTTGG(SEQ ID N°75)；‑GTGCCTCTCGGGGCTTCTGCCG(SEQ ID N°76)；‑CCTGTGTAGTAATGCTTAGCTTACAC(SEQ ID N°77)；‑CTACGGAGGGGTGGCTGCGTTG(SEQ ID N°78)；‑CTACGGAGGGGTGGCTGCGTTG(SEQ ID N°79)；‑ACAGCTCTGAGCAAAAATTCAAAATG(SEQ ID N°80)；‑GTCCAATGTAGGCGCAGCGTAA(SEQ ID N°81)；‑ATTAGCTGGAACCTCTTGTGGACC(SEQ ID N°82)；‑ATTAGCTGGAACCTCTTGTGGACC(SEQ ID N°83)；‑CTCATTAAACAATTTTTTCTTATAAAGATTG(SEQ ID N°84)；‑GTCATTGCACTCAGGTAGACGTAACA(SEQ ID N°85)；‑CTTTTTTCTTTTGGAAAAGGTTGACG(SEQ ID N°86)；‑ACAGACAATTTTATTGAACACTTTTT(SEQ ID N°87)；‑TTTGAAGAGTTGGCGGATCGGTAT(SEQ ID N°88)；‑ACGGACAATTTTATTTAACACTTTTG(SEQ ID N°89)；‑GCCCTTAAAAKCAGTGGCGGACC(SEQ ID N°90)；‑TAATACATGCAAGTCGAGCGGACAGAT(SEQ ID N°91)；‑GGGTACTTACCTAATACGTGAGTAT(SEQ ID N°92)；‑GAAGGGTARTGTCTTAATACGGCATT(SEQ ID N°93)；‑GGAAGGGYAGTGTGTTAATAGCAC(SEQ ID N°94)；‑ATGACTGTCCATCGCATGGTGGAT(SEQ ID N°95)；‑CTGCGGATCGCATGGTCTGCG(SEQ ID N°96)；‑AATACTTCTCCTCGCATGGGGAGG(SEQ ID N°97)；‑ATGACACACGACCGCATGGTCTGT(SEQ ID N°98)；‑CACCGGAAACGGCCAGAGATGGTCG(SEQ ID N°99)；和‑GAGTGTGGTAGAGGATGGCGGAA(SEQ ID N°100)；(ii)与以下序列具有至少80％同一性的序列：SEQ N°1SEQ ID N°2,SEQ ID N°3,SEQ ID N°4,SEQ ID N°5,SEQ ID N°6,SEQ ID N°7,SEQ ID N°8,SEQ ID N°9,SEQ ID N°10,SEQ ID N°11,SEQ ID N°12,SEQ ID N°13,SEQ ID N°14,SEQ ID N°15,SEQ ID N°16,SEQ ID N°17,SEQ ID N°18,SEQ ID N°19,SEQ ID N°20,SEQ ID N°21,SEQ ID N°22,SEQ ID N°23,SEQ ID N°24,SEQ ID N°25,SEQ ID N°26,SEQ ID N°27,SEQ ID N°28,SEQ ID N°29,SEQ ID N°30,SEQ ID N°31,SEQ ID N°32,SEQ ID N°33,SEQ ID N°34,SEQ ID N°35,SEQ ID N°36,SEQ ID N°37,SEQ ID N°38,SEQ ID N°39,SEQ ID N°40,SEQ ID N°41,SEQ ID N°42,SEQ ID N°43,SEQ ID N°44,SEQ ID N°45,SEQ ID N°46,SEQ ID N°47,SEQ ID N°48,SEQ ID N°49,SEQ ID N°50,SEQ ID N°51,SEQ ID N°52,SEQ ID N°53,SEQ ID N°54,SEQ ID N°55,SEQ ID N°56,SEQ ID N°57,SEQ ID N°58,SEQ ID N°59,SEQ ID N°60,SEQ ID N°61,SEQ ID N°62,SEQ ID N°63,SEQ ID N°64,SEQ ID N°65,SEQ ID N°66,SEQ ID N°67,SEQ ID N°68,SEQ ID N°69,SEQ ID N°70,SEQ ID N°71,SEQ ID N°72,SEQ ID N°73,SEQ ID N°74,SEQ ID N°75,SEQ ID N°76,SEQ ID N°77,SEQ ID N°78,SEQ ID N°79,SEQ ID N°80,SEQ ID N°81,SEQ ID N°82,SEQ ID N°83,SEQ ID N°84,SEQ ID N°85,SEQ ID N°86,SEQ ID N°87,SEQ ID N°88,SEQ ID N°89,SEQ ID N°90,SEQ ID N°91,SEQ ID N°92,SEQ ID N°93,SEQ ID N°94,SEQ ID N°95,SEQ ID N°96,SEQ ID N°97,SEQ ID N°98,SEQ ID N°99和SEQ ID N°100，或(iii)(i)或(ii)的互补序列。