[发明专利]一种菊花抗旱性关联分子标记的获得方法及应用

摘要

本发明属于生物技术领域，提供一种菊花抗旱性关联分子标记的获得方法，用于菊花抗旱性优良基因的定位和克隆及菊花新品种的培育。该获得方法包括a.抗旱性鉴定；b.菊花品种群体结构分析；c.菊花品种亲缘关系分析；d、与菊花抗旱性紧密关联的分子标记的确定。本方法同时运用SRAP、SCoT和EST-SSR三种分子标记技术，原理各不相同且各有针对，得到的染色条带多态性好，重复性高，可以覆盖整个基因组且条带数量非常丰富，有利于获得与抗旱性紧密相关的分子标记。共获得菊花抗旱性关联分子标记8个，实现优良抗旱品种提早选择，定向选择和准确选择，可以减少工作量，大大提高菊花抗旱基因型的选择效率，从而加快育种进程。

主权项

一种菊花抗旱性关联分子标记的获得方法，其特征在于包括以下步骤：a、抗旱性鉴定：选取不同来源且无直接亲缘关系的菊花品种，分别进行自然失水胁迫处理和穴盘快速干旱两种干旱胁迫处理；不同时间连续观察记录所有品种的失水萎蔫情况，鉴定抗旱性得出抗旱性数据；对抗旱性数据进行基本描述性统计分析；b、菊花品种群体结构分析：1)提取菊花品种的基因组DNA；2)随机选取菊花品种基因组DNA，对SRAP、SCoT和EST‑SSR引物组合进行筛选，将筛选出的扩增条带清晰、稳定且多态性丰富的引物组合用于菊花品种的全基因组分子标记扫描，统计扫描得到的多态性条带数据结果；3)对菊花品种群体进行类群划分，计算各个品种的Q值即某个品种的基因组变异源于某个群体的概率，并绘制出群体结构图；c、菊花品种亲缘关系分析：根据三种标记的整合数据分析品种间的亲缘关系，得到亲缘关系系数K矩阵；d、与菊花抗旱性紧密关联的分子标记的确定：应用TESSLE 3.0软件中的混合线性模型MLM进行抗旱性与分子标记的关联分析，将步骤b群体分析中所得到的各个品种的Q值和步骤c亲缘关系分析中得到的K矩阵都作为协变量计入模型；在抗旱性鉴定数据的关联分析中都检测到的分子标记位点即可确定为与菊花抗旱性紧密关联的分子标记，同时得出该标记位点的表型变异解释率R²。