[发明专利]一种辐射防护中基于GPU加速的体素人体模型剂量评估加速方法有效
| 申请号: | 201410528520.X | 申请日: | 2014-10-09 |
| 公开(公告)号: | CN104298871A | 公开(公告)日: | 2015-01-21 |
| 发明(设计)人: | 李廷;何桃;尚雷明;程梦云;龙鹏程 | 申请(专利权)人: | 中国科学院合肥物质科学研究院 |
| 主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 北京科迪生专利代理有限责任公司 11251 | 代理人: | 成金玉;孟卜娟 |
| 地址: | 230031 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种辐射防护中基于GPU加速的体素人体模型剂量评估加速方法,与常规方法不同之处在于:结合CPU复杂逻辑和事物等串行计算,使用图形处理器(Graphic Processor Unit,GPU)处理剂量计算中体素当量剂量,该过程存在数据量大、数据相关性低、数据有相同的执行程序,并行度和计算密度高等特点。因而通过GPU,可以让更多的计算单元并行执行,缩短计算时间,提高计算效率,实现体素人体模型剂量实时计算效果。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 辐射 防护 基于 gpu 加速 人体模型 剂量 评估 方法 | ||
【主权项】:
一种辐射防护中基于GPU加速的体素人体模型剂量评估加速方法,其特征在于:使用了CPU与GPU联合进行剂量计算,对于一些具有并行条件的处理过程使用GPU进行加速处理,而复杂逻辑和事务处理等串行计算仍然采用CPU;实现步骤包括:(1)在CPU平台上形成体素人体模型参数;(2)选定用于确定体素剂量的GPU,为GPU分配存储空间,向GPU传送步骤(1)中的体素人体模型参数的计算数据,需要传送的数据包括体素序列、器官名和ID与U号对应关系和体素精度;(3)利用GPU并行计算体素人体模型每个体素的剂量,剂量评估是在体素模型参数基础上,利用通量剂量转换方法,即已知自由空间的通量,借助转换因子,分别计算每个体素的吸收剂量,利用GPU并行计算每个体素的剂量,每个GPU线程计算一个体素的剂量,最后将所有体素剂量平均即为器官吸收剂量。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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