[发明专利]一种优化的重叠混合测序方法

摘要

本发明公开了一种优化的重叠混合测序方法，包括如下步骤：基于测序过程中测序深度服从负二项分布、测序错误服从二项分布的一般规律，提出了混合测序的深度模型，并基于此模型计算并设计了混合测序的最佳深度，通过降低冗余测序深度有效减少测序成本；提出了一种基于稀有突变分布概率的分组重叠混合测序方法，与直接测序相比，分组策略将大幅减少测序数据量需求，提高混合测序效率；建立了测序代价模型，并基于此模型选择最优的重叠混合测序方案来筛选稀有突变的携带者。本发明最大程度降低筛选稀有突变携带者的测序成本。

主权项

一种优化的重叠混合测序方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一、根据混合测序深度模型计算最优测序深度，对样本进行分组重叠混合测序，并根据测序代价模型选择最佳测序方案；其中，最优测序深度是根据测序深度服从负二项分布、测序错误服从二项分布，计算得到满足假阳性错误和假阴性错误要求的最低测序深度；分组重叠混合测序：将大规模样本分成数个小组，根据已知稀有突变的概率计算每个小组中稀有突变携带者的可能个数，然后再对每个小组进行独立的重叠混合测序；建立合理的测序代价模型：综合考虑文库制备、测序数据两方面的成本，并根据代价模型计算重叠混合测序方案的成本，选择最优的重叠混合测序方案；步骤二、利用上述方法开展从大量样本中筛查稀有突变携带者的高通量测序实验。