[发明专利]利用UBE3基因构建核苷酸分子式鉴定植物品种的方法

摘要

本发明公开了一种鉴定植物品种的方法。本发明提供了鉴定紫薇品种的方法，包括如下步骤：1)以待测紫薇的基因组DNA为模板，用由序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；2)将所述PCR产物测序，根据测序结果列出所述待测紫薇的核苷酸分子式；3)将步骤2)所得的核苷酸分子式与对应的若干个紫薇品种的核苷酸分子式进行比对，从而确定所述待测紫薇的品种。实验证明，该方法精确、操作简捷，可以提高相关产业的生产效率和质量监控水平，有效弥补以往方法的不足；另外，该方法同时实现了非花期(如苗期)的鉴定。本方法对于促进紫薇的新品种选育、紫薇花木产业与城市园林绿化事业的发展以及环境保护具有重要意义。

主权项

一种鉴定或辅助鉴定待测紫薇品种的方法，包括如下步骤：(1)以待测紫薇的基因组DNA为模板，用由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；(2)将所述PCR产物测序后，截掉所述PCR产物的核苷酸序列自5’末端起的前76个核苷酸，剩余序列作为待比对序列；(3)将所述待比对序列与DNA序列库中的全部序列放在一起进行比对，得到DNA比对序列矩阵；所述DNA序列库为如下(a1)或(a2)：(a1)由序列表中序列3和/或序列4组成；(a2)由序列表中序列3和序列4中的至少一种，和序列5至序列10中的至少一种组成；(4)根据所述DNA比对序列矩阵列出所述待测紫薇的核苷酸分子式；所述待测紫薇的核苷酸分子式的通式为：B152B161B173B215B221B245B294B299B426B431B440B462B527B551B557；在所述通式中，所述B152、所述B161、所述B173、所述B215、所述B221、所述B245、所述B294、所述B299、所述B426、所述B431、所述B440、所述B462、所述B527、所述B551和所述B557，依次表示在所述DNA比对序列矩阵中的第152、161、173、215、221、245、294、299、426、431、440、462、527、551和557个位点；在所述通式中，每一个B为A、T、C和G中的任一种或两种；(5)将步骤(4)所得所述待测紫薇的核苷酸分子式与核苷酸分子式组I进行比对；所述核苷酸分子式组I由如下a1)‑a8)共8种核苷酸分子式组成：a1)Y152G161C173Y215R221G245R294C299C426C431A440A462C527A551G557；a2)Y152K161Y173Y215G221G245G294C299C426Y431R440A462Y527A551G557；a3)T152G161C173C215A221G245G294C299C426C431A440G462C527A551A557；a4)Y152K161Y173C215R221G245G294C299C426Y431R440R462T527A551G557；a5)Y152G161C173C215R221G245G294C299C426C431R440R462C527A551R557；a6)Y152K161Y173C215R221G245G294C299C426Y431R440R462Y527A551R557；a7)C152G161C173C215G221G245G294C299C426C431G440A462C527A551G557；a8)C152K161Y173C215G221G245G294C299C426Y431G440A462Y527A551G557；在a1)‑a8)中，M表示A和C；K表示G和T；Y表示T和C；R表示A和G；W表示A和T；(6)根据步骤(5)的比对结果，按照如下方法对所述待测紫薇进行品种鉴定：若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a1)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘翠盘红粉’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a2)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘红环直枝紫’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a3)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘小花杂种粉’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a4)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘宝庆淡紫’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a5)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘大白花’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a6)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘芙蓉面’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a7)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘建民粉’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a8)所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘多花紫云’。