[发明专利]一种用于分析蛋白质序列的性质的方法和装置有效

专利信息
申请号: 201410123836.0 申请日: 2014-03-28
公开(公告)号: CN104951667B 公开(公告)日: 2018-04-17
发明(设计)人: 丁建栋;张亚楠;严骏驰;黄振;张超 申请(专利权)人: 国际商业机器公司
主分类号: G06F19/16 分类号: G06F19/16
代理公司: 北京市金杜律师事务所11256 代理人: 酆迅,李峥宇
地址: 美国纽*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 发明提供了一种用于分析蛋白质序列的性质的方法和装置。在一个实施方式中,提供了一种用于分析蛋白质序列的性质的方法,包括响应于接收到蛋白质序列,从参考数据库中查找与蛋白质序列相匹配的至少一个参考蛋白质序列;通过比较蛋白质序列和至少一个参考蛋白质序列构成的集合中的任意两个序列,分别将蛋白质序列和至少一个参考蛋白质序列映射至特征向量和至少一个参考向量;利用至少一个参考向量以及至少一个参考蛋白质序列的性质来训练分类器;以及由分类器来基于特征向量,分析蛋白质序列的性质。在另一实施方式中,提供了一种用于分析蛋白质序列的性质的装置。采用本发明,可以在无需进行人工试验的情况下,获得蛋白质序列的多方面的性质。
搜索关键词: 一种 用于 分析 蛋白质 序列 性质 方法 装置
【主权项】:
一种用于分析蛋白质序列的性质的方法,包括:响应于接收到所述蛋白质序列,从参考数据库中查找与所述蛋白质序列相匹配的至少一个参考蛋白质序列;通过比较所述蛋白质序列和所述至少一个参考蛋白质序列构成的集合中的任意两个序列,分别将所述蛋白质序列和所述至少一个参考蛋白质序列映射至特征向量和至少一个参考向量,其中所述至少一个参考蛋白质序列包括两个或者更多的参考蛋白质序列,包括:分别将所述蛋白质序列与所述至少一个参考蛋白质序列中的任一项进行比较,以将所述蛋白质序列映射至所述特征向量;以及针对所述至少一个参考蛋白质序列中的当前参考蛋白质序列,分别将所述当前参考蛋白质序列与所述至少一个参考蛋白质序列中除所述当前参考蛋白质序列以外的每个参考蛋白质序列以及所述蛋白质序列进行比较,以将所述当前参考蛋白质序列映射至相应的参考向量;利用所述至少一个参考向量以及所述至少一个参考蛋白质序列的性质来训练分类器;以及由所述分类器来基于所述特征向量,分析所述蛋白质序列的性质。
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