[发明专利]制备靶RNA消除组合物的方法和试剂盒

摘要

本发明提供从初始的含RNA组合物制备靶RNA消除组合物的方法，包括a)使初始的含RNA组合物与一组或多组探针分子接触并在靶RNA和探针分子之间产生双链杂交体，其中的探针分子组具有以下特征：i)该组包括长度为100nt或更小的两种或多种不同的探针分子；ii)包含于所述组中的探针分子与靶RNA中的靶区域互补；iii)当与所述靶区域杂交时，所述两种或多种不同的探针分子在形成的双链杂交体中处于彼此邻近的位置；b)利用结合双链杂交体的结合剂捕获所述双链杂交体，由此形成杂交体/结合剂复合物；c)从所述组合物中分离所述杂交体/结合剂复合物，从而提供靶RNA消除的组合物。通过组合杂交体捕获与独特的探针设计，提供了改进的消除方法，该方法有效和特异性地去除总RNA中不需要的靶RNA，如核糖体RNA(rRNA)，同时确保从包括人、小鼠和大鼠在内的不同物种回收mRNA和非编码RNA。通过改进有用数据之比、减少偏差并保留非编码RNA种类，该方法提供了尤其适用于下一代测序(NGS)应用的高质量RNA。通过在共同的测序应用，特别是NGS的应用，如转录组测序积分所述耗尽方法中，提供了改进的方法，用于测序的RNA分子。通过将所述消除方法整合入常规的测序应用，特别是NGS应用，例如转录组测序，为测序RNA分子提供了改进的方法。

主权项

一种从初始的含RNA组合物制备靶RNA消除组合物的方法，包括：a)使初始的含RNA组合物与一组或多组探针分子接触并在靶RNA和探针分子之间产生双链杂交体，其中的探针分子组具有以下特征：i)该组包括长度为100nt或更小的两种或多种不同的探针分子；ii)包含于所述组中的探针分子与靶RNA中的靶区域互补；iii)当与所述靶区域杂交时，所述两种或多种不同的探针分子在形成的双链杂交体中处于彼此邻近定位；b)利用结合双链杂交体的结合剂捕获所述双链杂交体，由此形成杂交体/结合剂复合物；c)从所述组合物中分离所述杂交体/结合剂复合物，从而提供靶RNA消除的组合物。