[发明专利]一种高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统及检测方法有效

专利信息
申请号: 201310585089.8 申请日: 2013-11-19
公开(公告)号: CN103559425B 公开(公告)日: 2017-02-15
发明(设计)人: 梁素钰;刘滨凡;田松岩;刘延坤;李琳;孙清芳;刘广菊;刘长乐;李云红;贾丹;杜倩;邵英男;王文帆;陈瑶;李东玫;刘玉龙;王刚 申请(专利权)人: 黑龙江省森林工程与环境研究所
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22
代理公司: 哈尔滨市船大专利事务所23201 代理人: 张贵丰
地址: 150081 黑龙*** 国省代码: 黑龙江;23
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要: 发明提供的是高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统及检测方法。包括依次相连的测序仪、数据库模块和数据处理模块。测序仪对所需测序基因进行测序并将测序数据存储到所述数据库模块中;数据处理模块包括数据归类模块、目标检测模块、有效数据模块、操作单元分类模块、相似度寻优模块、结果显示模块和无效数据模块。本发明针对高通量基因测序数据序列庞杂的特性,对所测数据序列进行归类参数的选取和效值的赋值或定义,经过数据归类子模块的循环递近归类,配合目标检测模块,判断是否进行数据归类优化,获得有效数据;并进行不同相似度下的操作单元优化分类,计算分类单元出现的频率,从而实现庞杂高通量基因序列的最优有效序列目标检测。
搜索关键词: 一种 通量 基因 有效 数据 分类 目标 检测 系统 方法
【主权项】:
一种高通量基因测序的有效数据分类寻优目标检测系统,包括依次相连的测序仪、数据库模块和数据处理模块,其特征是:所述测序仪对所需测序基因进行测序并将测序数据存储到所述数据库模块中;所述的数据处理模块包括数据归类模块、目标检测模块、有效数据模块、操作单元分类模块、相似度寻优模块、结果显示模块和无效数据模块,数据归类模块对所测数据序列进行归类处理,即所测数据序列若具有归类参数R的性质,则进行读取归类,所测数据序列若不具有归类参数R的性质,则该数据序列进入无效数据模块;目标检测模块对经过数据归类模块的循环递近归类后的数据序列进行同时满足所选归类参数有效值或有效定义的检测,通过同时满足所选归类参数有效值或有效定义的检测的数据序列,若是多于或者少于预定的实验分析数据序列数则进行数据优化;有效数据模块用以对满足循环递近归类的数据序列进行处理;操作单元分类模块用以对有效数据模块中的所有数据序列根据设定的相似度进行操作单元分类,并计算分类单元出现的频率;相似度寻优模块按照相似度的不同,设定相似度间隔百分点,将有效数据模块中的所有数据序列重新进行操作单元分类,输出操作单元分类结果及计算分类单元出现的频率;结果显示模块将目标检测模块的检测结果、有效数据模块的结果、操作单元分类模块的结果和计算分类单元出现的频率在结果显示模块上显示;无效数据模块存储数据归类模块和目标检测模块中的不符合要求的数据;所述归类参数R的性质包括序列长度、碱基有效序列、启动子序列、标签序列和控制序列。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于黑龙江省森林工程与环境研究所,未经黑龙江省森林工程与环境研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201310585089.8/,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top