[发明专利]与水稻大粒基因GS2紧密连锁的分子标记及其应用

摘要

本发明提供与水稻大粒基因GS2紧密连锁的分子标记及其应用。通过重组自交系高代粒形分离群体，将水稻粒形主效基因GS2精细定位至第2染色体上GS2-6到GS2-8的33.2kb范围内，获得一批与GS2紧密连锁的分子标记，其中包括公共数据库标记RM3212及自行开发的22个InDel标记（GS2-1到GS2-22）。本发明可有效检测GS2基因位点，从而提高大粒型品种（或亲本）的选育效率。

主权项

与水稻大粒基因GS2紧密连锁的分子标记，其特征在于，所述分子标记选自GS2‑1、GS2‑2、GS2‑3、GS2‑4、GS2‑5、GS2‑6、RM3212、GS2‑7、GS2‑8、GS2‑9、GS2‑10、GS2‑11、GS2‑12、GS2‑13、GS2‑14、GS2‑15、GS2‑16、GS2‑17、GS2‑18、GS2‑19、GS2‑20、GS2‑21和GS2‑22中的至少一种；上述用于PCR扩增分子标记的引物对为：1）分子标记名称，GS2‑1正向引物：5’‑ATACATTATGGGCACTAG‑3’反向引物：5’‑ATATTAAGGGCAACAGCA‑3’2）分子标记名称，GS2‑2正向引物：5’‑TTCAGTTCCTTCCTGGTCC‑3’反向引物：5’‑CCAATCCCAATCTGACCC‑3’3）分子标记名称，GS2‑3正向引物：5’‑GCCGTAGGAGTAAGACCC‑3’反向引物：5’‑TTTCACTTGCTCCATCCA‑3’4）分子标记名称，GS2‑4正向引物：5’‑GCCGCCTTTTGGGTGGTA‑3’反向引物：5’‑CCTTCCTTCTCCCTGCTTC‑3’5）分子标记名称，GS2‑5正向引物：5’‑GTGGCACCATTGTTCTGT‑3’反向引物：5’‑CTCTGGCCCCTGCATTAA‑3’6）分子标记名称，GS2‑6正向引物：5’‑GAGTATAGTATGTGGCGACGTG‑3’反向引物：5’‑GATGTGGGAGGTTGGAGC‑3’7）分子标记名称，RM3212正向引物：5’‑AGACGACAAACACCTGCCTC‑3’反向引物：5’‑CAAACACAAACGCAGCCTC‑3’8）分子标记名称，GS2‑7正向引物：5’‑GAGAAAGCCATTAGTGCA‑3’反向引物：5’‑TCTACCAAACCAAAACAA‑3’9）分子标记名称，GS2‑8正向引物：5’‑GGGTGCCGCTGGTAGAAT‑3’反向引物：5’‑ACCGCTCGCTGAGAAGAA‑3’10）分子标记名称，GS2‑9正向引物：5’‑CATACCTCCGCAACCTTC‑3’反向引物：5’‑AGCACGCAATACAAACAT‑3’11）分子标记名称，GS2‑10正向引物：5’‑TATAGATGATGCATGAGA‑3’反向引物：5’‑ATTGTAGATGGTGTCGTC‑3’12）分子标记名称，GS2‑11正向引物：5’‑GGGGTCTTGTACCTTTCA‑3’反向引物：5’‑ATGGAGTATGGGATTTGG‑3’13）分子标记名称，GS2‑12正向引物：5’‑TGGATCTAACGAGGAAAG‑3’反向引物：5’‑CATCTGCCAATAGGTAAT‑3’14）分子标记名称，GS2‑13正向引物：5’‑AAGGGAACAAGTTGTAAA‑3’反向引物：5’‑AGTGAAGTGAGCAAGGAC‑3’15）分子标记名称，GS2‑14正向引物：5’‑GCACCTCTTGGTTCGTCA‑3’反向引物：5’‑CGTTCATCCGGCTATTGT‑3’16）分子标记名称，GS2‑15正向引物：5’‑CCCGTGTTCACTGTTCAA‑3’反向引物：5’‑TACGCCAGGATCTCGTCA‑3’17）分子标记名称，GS2‑16正向引物：5’‑ACCTTTCCCGTATTTGCTC‑3’反向引物：5’‑CCCTTGGGTATCATCTAGTGC‑3’18）分子标记名称，GS2‑17正向引物：5’‑TAGTAGATAGTCAAGGATTC‑3’反向引物：5’‑ATGATGGTTTGCTTTTCA‑3’19）分子标记名称，GS2‑18正向引物：5’‑ACATCAACCCTAAAGTAT‑3’反向引物：5’‑CACTGACGAGATTGTATC‑3’20）分子标记名称，GS2‑19正向引物：5’‑TCGGAGACCAAGCACATAG‑3’反向引物：5’‑GAGCAGTCACGACCAACG‑3’21）分子标记名称，GS2‑20正向引物：5’‑GAGGACGCCGTTTACCAG‑3’反向引物：5’‑GTGAGCGAGCTACCGAAT‑3’22）分子标记名称，GS2‑21正向引物：5’‑CCCATCTCCATACTTCAA‑3’反向引物：5’‑CAAACCAAACCAGCCCTA‑3’23）分子标记名称，GS2‑22正向引物：5’‑AATAGTCGTAGGCTCTTAG‑3’反向引物：5’‑CGCCTTATTATCCCATAT‑3’。