[发明专利]中医证候的分子解释工具构造方法有效
申请号: | 201310208018.6 | 申请日: | 2013-05-30 |
公开(公告)号: | CN103279666A | 公开(公告)日: | 2013-09-04 |
发明(设计)人: | 高一波;代文;卢朋;刘西;陈琳;宋江龙;陈迪 | 申请(专利权)人: | 中国科学院自动化研究所 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 宋焰琴 |
地址: | 100190 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种中医证候分子解释工具构造方法,包括如下步骤:计算症状与中医证候之间的信息增益;根据多个不同的信息增益阈值来筛选出多个不同的症状集,并构建基于该多个不同症状集的支持向量机分类模型;将多组支持向量机模型中的预测准确率最高的一组支持向量机分类模型对应的症状集作为核心症状;确定核心症状对应的表型本体条目以及表型本体条目关联的基因,筛选出频繁基因;根据频繁基因和分子层面的数据来构造用于中医证候解释的分子解释工具。本发明通过筛选出中医证候的核心症状和获得频繁基因,能够构造阐释核心症状的分子机制的分子解释工具,该工具有助于更好的认识中医证候的机理。 | ||
搜索关键词: | 中医 分子 解释 工具 构造 方法 | ||
【主权项】:
一种中医证候分子解释工具构造方法,所述分子解释工具用于从分子层面阐释中医证候的机理,其特征在于,所述方法包括如下步骤:步骤S1:根据中医病例样本数据,计算症状与中医证候之间的信息增益;步骤S2:根据多个不同的信息增益阈值来筛选出多个不同的症状集,并构建基于该多个不同症状集的支持向量机分类模型;步骤S3:将所述多组支持向量机模型中的预测准确率最高的一组支持向量机分类模型对应的症状集作为核心症状;步骤S4:确定所述核心症状对应的表型本体条目以及表型本体条目关联的基因,依据关联基因的出现频率对基因进行排序,并设置一个频率阈值来筛选出频繁基因;步骤S5:根据所述筛选得到的频繁基因和生物通路图数据来构造用于中医证候解释的分子解释工具。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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