[发明专利]功能改性的寡核苷酸及其亚单元在审

专利信息
申请号: 201280066138.0 申请日: 2012-11-15
公开(公告)号: CN104039739A 公开(公告)日: 2014-09-10
发明(设计)人: 贡纳·J·汉森;德怀特·D·怀勒;蔡宝忠;周明 申请(专利权)人: 萨勒普塔医疗公司
主分类号: C04B40/06 分类号: C04B40/06
代理公司: 北京英赛嘉华知识产权代理有限责任公司 11204 代理人: 王达佐;洪欣
地址: 美国华*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 提供了包含修饰的亚基间连接和/或修饰的3’端和/或5’端基团的功能改性的寡核苷酸类似物。本公开的化合物可用于治疗疾病,其中抑制蛋白表达或校正异常mRNA剪接产物产生了有益的疗效。
搜索关键词: 功能 改性 寡核苷酸 及其 单元
【主权项】:
具有式(I)结构的化合物:或其盐或异构体,其中:n为1‑50的整数;G5为卤素、OH、烃氧基、OSO2(烃基)、OSO2(芳基)或每个B为独立选择的碱基对部分;每个Y独立地为O或NR10;任选地,R10和X8e结合在一起形成环;每个W独立地为S或O;Z5为‑(L11)‑(R15)、‑(L11)‑(L15)‑(R16)或‑(L11)‑(L12)‑(R17);L11选自:或k)–C(R23)2O‑;其中L13选自:L12为选自以下的生物条件下可切割的连接臂:a)‑(C1‑C10亚烃基)‑OC(O)O‑CH2O‑;b)‑C(O)‑(C1‑C10亚烃基)‑OC(O)O‑CH2O‑;c)‑C(O)‑(CH=CH)‑C(O)O‑CH2O‑;d)‑(C1‑C10亚烃基)‑S‑S‑CH2CH2O‑;或e)‑C(O)‑(C1‑C10亚烃基)‑S‑S‑CH2CH2O‑;L15为选自以下的二价基团:C1‑C30亚烃基、C3‑C8环亚烃基、C6‑C30亚芳基、‑(C6‑C30亚芳基)‑(C1‑C30亚烃基)‑、‑(C1‑C30亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C2‑C30烃氧基)‑C(=O)‑、‑(3‑18元杂亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C3‑C8环亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C3‑C8环亚烃基)‑(C1‑C30亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C1‑C30亚烃基)(C3‑C8环亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C6‑C30亚芳基)‑C(=O)‑、‑(C6‑C30亚芳基)‑(C1‑C30亚烃基)‑C(=O)‑、‑(C1‑C30亚烃基)‑(C6‑C30亚芳基)‑C(=O)‑、‑(C1‑C30亚烃基)‑O‑C(=O)‑、‑(C3‑C8环亚烃基)‑O‑C(=O)‑、‑(C7‑C30亚芳基)‑O‑C(=O)‑、‑(C6‑C30亚芳基)‑(C1‑C30亚烃基)‑O‑C(=O)‑、‑(C6‑C30亚芳基)‑(C1‑C30亚烃基)‑O‑C(=O)‑、‑C(=O)OR21或‑P(=O)(R22)2;R12为电子对,条件是如果R13为C1‑C30烃基,则R12为电子对、N‑氧化物或C1‑C6烃基;每个R10和R13独立地选自氢、细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1‑C30烃基、C3‑C8环烃基;C6‑C30芳基、C7‑C30芳烃基、C1‑C30烃基羰基、C3‑C8环烃基羰基、C3‑C8环烃基烃基羰基、C6‑C30芳基羰基、C7‑C30芳烃基羰基、C1‑C30烃氧羰基、C3‑C8环烃氧羰基、C7‑C30芳氧基羰基、C8‑C30芳烃氧羰基、‑C(=O)OR21、‑C(=O)NHR21或‑P(=O)(R22)2;R15独立地选自:细胞穿透肽、天然或非天然氨基酸、胍基、脒基、杂环基、C1‑C30烃基、C3‑C8环烃基;C6‑C30芳基、C7‑C30芳烃基、C1‑C30烃基羰基、C3‑C8环烃基羰基、C3‑C8环烃基烃基羰基、C6‑C30芳基羰基、C7‑C30芳烃基羰基、C2‑C30烃氧羰基、C3‑C8环烃氧羰基、C7‑C30芳氧基羰基、C8‑C30芳烃氧羰基、3‑18元烃氧基烃基羰基、‑SO2R21、‑C(=O)OR21、‑P(=O)(OH)2或‑P(=O)(R22)2;R16为适于寡核苷酸的固相合成的固体支持基质;R17为药物、蛋白或毒素;每个R21独立地为C1‑C30烃基或3‑18元烃氧基烃基;每个R22独立地为C6‑C12芳氧基;每个R23独立地为H或C1‑C6烃基;或者任选地两个R23基团连接形成3‑8元环;R24为C1‑C6亚烃基;Q独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8;每个X独立地选自X1、X2、X3、X4、X5、X6、X7或X8,条件是至少一个X不为X1;其中X1为N(CH3)2;X2选自:a)‑O‑亚烃基‑CO2H;b)‑O‑亚烃基‑CHN4;c)‑N(R1)‑亚烃基‑CO2H;d)‑N(R1)‑亚烃基‑CHN4;e)‑L1‑CO‑亚烃基‑CO2H;f)‑L1‑CO‑亚烃基‑CHN4;g)‑L1‑CO‑亚烯基‑CO2H;h)‑L1‑CO‑亚烯基‑CHN4;i)‑L1‑CO‑亚芳基‑CO2H;j)‑L1‑CO‑亚芳基‑CHN4;k)‑L1‑CONH‑亚烃基‑CO2H;l)‑L1‑CONH‑亚烃基‑CHN4;m)‑L1‑CONH‑亚芳基‑CO2H;n)‑L1‑CONH‑亚芳基‑CHN4;o)‑L1‑SO2‑亚烃基‑CO2H;p)‑L1‑SO2‑亚烃基‑CHN4;q)‑L1‑SO2‑亚芳基‑CO2H;r)‑L1‑SO2‑亚芳基‑CHN4;s)‑L1‑亚烃基‑CO2H;t)‑L1‑亚烃基‑CHN4;u)‑L1‑亚芳基‑CO2H;v)‑L1‑亚芳基‑CHN4;和w)保护形式的任何以上X2基团;X3选自:a)‑L1‑烃基;b)‑L1‑杂环基;c)‑O‑亚烃基‑CNH‑NH2;d)‑N(R1)‑亚烃基‑CNH‑NH2;e)‑L1‑CNH‑NH2;f)‑L1‑亚烃基‑CNH‑NH2;g)‑L1‑亚芳基‑CNH‑NH2;h)‑L1‑CO‑亚烃基‑CNH‑NH2;i)‑L1‑CO‑亚烯基‑CNH‑NH2;j)‑L1‑CO‑亚芳基‑CNH‑NH2;k)‑L1‑CONH‑亚烃基‑CNH‑NH2;l)‑L1‑CONH‑亚芳基‑CNH‑NH2;m)‑L1‑SO2‑亚烃基‑CNH‑NH2;n)‑L1‑SO2‑亚芳基‑CNH‑NH2;o)‑O‑亚烃基‑N(R1)2;p)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)2;q)‑L1‑N(R1)2;r)‑L1‑亚烃基‑N(R1)2;s)‑L1‑亚芳基‑N(R1)2;t)‑L1‑CO‑亚烃基‑N(R1)2;u)‑L1‑CO‑亚烯基‑N(R1)2;v)‑L1‑CO‑亚芳基‑N(R1)2;w)‑L1‑CONH‑亚烃基‑N(R1)2;x)‑L1‑CONH‑亚芳基‑N(R1)2;y)‑L1‑SO2‑亚烃基‑N(R1)2;z)‑O‑亚烃基‑N(R2)3;aa)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R2)3;bb)‑L1‑N(R2)3;cc)‑L1‑亚烃基‑N(R2)3;dd)‑L1‑亚芳基‑N(R2)3;ee)‑L1‑CO‑亚烃基‑N(R2)3;ff)‑L1‑CO‑亚烯基‑N(R2)3;gg)‑L1‑CO‑亚芳基‑N(R2)3;hh)‑L1‑CONH‑亚烃基‑N(R2)3;ii)‑L1‑CONH‑亚芳基‑N(R2)3;jj)‑L1‑SO2‑亚烃基‑N(R2)3;kk)‑O‑亚烃基‑杂环基;ll)‑N(R1)‑亚烃基‑杂环基;mm)‑L1‑亚烃基‑杂环基;nn)‑L1‑亚芳基‑杂环基;oo)‑L1‑CO‑亚烃基‑杂环基;pp)‑L1‑CO‑亚烯基‑杂环基;qq)‑L1‑CO‑亚芳基‑杂环基;rr)‑L1‑CONH‑亚烃基‑杂环基;ss)‑L1‑CONH‑亚芳基‑杂环基;tt)‑L1‑SO2‑亚烃基‑杂环基;uu)‑O‑亚烃基‑N(O)(R2)2;vv)‑N(R1)‑亚烃基‑N(O)(R2)2;ww)‑L1‑N(O)(R2)2;xx)‑L1‑亚烃基‑N(O)(R2)23;yy)‑L1‑亚芳基‑N(O)(R2)2;zz)‑L1‑CO‑亚烃基‑N(O)(R2)2;aaa)‑L1‑CO‑亚烯基‑N(O)(R2)23;bbb)‑L1‑CO‑亚芳基‑N(O)(R2)2;ccc)‑L1‑CONH‑亚烃基‑N(O)(R2)2;ddd)‑L1‑CONH‑亚芳基‑N(O)(R2)2;eee)‑L1‑SO2‑亚烃基‑N(O)(R2)2;fff)‑O‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;ggg)‑N(R1)‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;hhh)‑L1‑NH‑CNH‑NH2;iii)‑L1‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;jjj)‑L1‑亚芳基‑NH‑CNH‑NH2;kkk)‑L1‑CO‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;lll)‑L1‑CO‑亚烯基‑NH‑CNH‑NH2;mmm)‑L1‑CO‑亚芳基‑NH‑CNH‑NH2;nnn)‑L1‑CONH‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;ooo)‑L1‑CONH‑亚芳基‑NH‑CNH‑NH2;ppp)‑L1‑SO2‑亚烃基‑NH‑CNH‑NH2;qqq)‑L1‑SO2‑亚芳基‑NH‑CNH‑NH2;和rrr)保护形式的任何以上X3基团;条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X7存在为哌啶基,则X3不为X4选自:a)‑O‑亚烃基‑芳基;b)‑N(R1)‑芳基;c)‑N(R1)‑亚烃基‑芳基;d)‑L1‑CO‑亚烃基‑芳基;e)‑L1‑CO‑亚烯基‑芳基;f)‑L1‑CO‑亚芳基‑芳基;g)‑L1‑CONH‑亚烃基‑芳基;h)‑L1‑CONH‑亚芳基‑芳基;i)‑L1‑SO2‑亚烃基‑芳基;j)‑L1‑SO2‑亚芳基‑芳基;k)‑L1‑亚烃基‑芳基;l)‑L1‑亚芳基‑芳基;m)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)‑芳基;n)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)CO‑芳基;o)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)SO2‑芳基;p)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)CH2‑芳基;q)‑L1‑芳基;r)‑L1‑CO‑芳基;s)‑L1‑SO2‑芳基;t)‑L1‑亚烃基‑P(芳基)3;u)‑L1‑CO‑亚烃基‑P(芳基)3;v)‑L1‑SO2‑亚烃基‑P(芳基)3;和w)保护形式的任何以上X4基团;X5选自:a)‑O‑亚烃基‑杂芳基;b)‑N(R1)‑亚烃基‑杂芳基;c)‑L1‑CO‑亚烃基‑杂芳基;d)‑L1‑CO‑亚烯基‑杂芳基;e)‑L1‑CO‑亚芳基‑杂芳基;f)‑L1‑CONH‑亚烃基‑杂芳基;g)‑L1‑CONH‑亚芳基‑杂芳基;h)‑L1‑SO2‑亚烃基‑杂芳基;i)‑L1‑SO2‑亚芳基‑杂芳基;j)‑L1‑亚烃基‑杂芳基;k)‑L1‑亚芳基‑杂芳基;l)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)‑杂芳基;m)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)CO‑杂芳基;n)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)SO2‑杂芳基;o)‑N(R1)‑亚烃基‑N(R1)CH2‑杂芳基;p)‑L1‑杂芳基;和q)保护形式的任何以上X5基团;X6选自:a)‑O‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOH;b)‑O‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOCH3;c)‑N(R1)‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOH;d)‑N(R1)‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOCH3;e)‑N(R1)‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOH;f)‑N(R1)‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOCH3;g)‑L1‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOH;h)‑L1‑CO‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOH;i)‑L1‑CO‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOCH3;j)‑L1‑SO2‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOH;k)‑L1‑SO2‑亚烃基‑(OCH2CH2)mOCH3;l)‑L1‑CO‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOH;m)‑L1‑CO‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOCH3;n)‑L1‑SO2‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOH;o)‑L1‑SO2‑亚芳基‑(OCH2CH2)mOCH3;p)‑L1‑CO‑(OCH2CH2)mOH;q)‑L1‑CO‑(OCH2CH2)mOCH3;r)‑N(R1)‑(二苯并‑18‑冠‑6);s)氮杂‑冠醚;和t)保护形式的任何以上X6基团;X7选自:a)‑杂环基;b)‑N(R1)(R3)c)‑L1‑氢;d)‑L1‑烃基;e)‑L1‑CO‑烃基;f)‑L1‑CONH‑烃基;g)‑L1‑CON(烃基)‑烃基;h)‑L1‑SO2‑烃基;和i)保护形式的任何以上X7基团;条件是如果X1存在为N(CH3)2,且X3存在为则X7不为哌啶基;X8选自:a)‑L1‑CA;b)‑L1‑dCA;c)‑L1‑COCH2(R4);d)‑L1‑COCH(R4)NHCO2‑烃基;e)‑OR5,其中R5和R10一起形成环;f)保护形式的任何以上X8基团;每个R1独立地为氢、烃基或细胞穿透肽;每个R2独立地为C1‑C12烃基,或者任选地当两个R2为C1‑C12烃基时,两个R2连接形成杂环;每个R3独立地为C2‑C18烃基、烯基或炔基;每个R4独立地为氢、烃基、羟基烃基、巯基烃基或芳基烃基;每个R5独立地为C1‑C12烃基;每个R6独立地为氢或C1‑C12烃基;L1选自:其中每个Q1和Q2分别选自键、‑O‑或‑N(R6)‑;每个E1独立地选自任选取代的芳基或任选取代的杂芳基;每个E2独立地为任选取代的含氮的杂芳基;每个L4和L5分别独立地为键、任选取代的C1‑C6烃基或任选取代的杂烃基;并且m、p、q、s和t分别独立地为1‑4。
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