[发明专利]使用生物信息学字符集和和映射的生物信息学字体的基因组／蛋白质组序列的表示、可视化，比较以及报告在审
| 申请号： | 201280033367.2 | 申请日： | 2012-07-04 |
| 公开（公告）号： | CN103797487A | 公开（公告）日： | 2014-05-14 |
| 发明（设计）人： | R·辛格;S·库马尔;B·查克拉巴蒂 | 申请（专利权）人： | 皇家飞利浦有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/26 | 分类号： | G06F19/26;G06F19/22 |
| 代理公司： | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人： | 王健 |
| 地址： | 荷兰艾*** | 国省代码： | 荷兰;NL |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 基因组或蛋白质组数据被编码为包括生物信息学字符集(20)的字符的基因组或蛋白质组字符串。基因组或蛋白质组数据的每一个碱基或肽通过生物信息学字符集的单个字符来表示，以及生物信息学字符集的每个字符编码(I)碱基或肽以及(II)与该碱基或肽相关联的至少一个注释的数据值。该基因组或蛋白质组数据通过使用映射到生物信息学字符集的生物信息学字体(40)显示基因组或蛋白质组字符串来被显示。至少一个字符串函数可在基因组或蛋白质组字符串上执行以生成更新的基因组或蛋白质组字符串，其中至少一个碱基或肽由编码了至少一个附加的或修改的注释的数据的单个字符表示，该字符由执行的字符串操作生成。 | ||
| 搜索关键词： | 使用 生物 信息学 字符集 映射 字体 基因组 蛋白质 序列 表示 可视化 比较 以及 报告 | ||
【主权项】：
一种方法，特征在于所述方法包括：将基因组或蛋白质组数据编码为包括生物信息学字符集的字符的基因组或蛋白质组字符串，其中：(i)基因组或蛋白质组数据的每个碱基或肽由生物信息学字符集(20)的单个字符表示，以及(ii)所述生物信息学字符集的每个字符编码(I)碱基或肽和(II)与所述碱基或肽相关联的至少一个注释的数据值；以及通过使用映射到生物信息学字符集的生物信息学字体(40)显示基因组或蛋白质组字符串来显示所述基因组或蛋白质组数据；其中，所述编码和显示由数字处理设备(50)执行。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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