[发明专利]用于处理基因组数据的方法在审
申请号: | 201280005927.3 | 申请日: | 2012-01-19 |
公开(公告)号: | CN103329138A | 公开(公告)日: | 2013-09-25 |
发明(设计)人: | V·V·马卡帕蒂;N·迪米特罗娃;R·辛格;S·K·亚格兰 | 申请(专利权)人: | 皇家飞利浦电子股份有限公司 |
主分类号: | G06F19/22 | 分类号: | G06F19/22 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人: | 左路;林晓红 |
地址: | 荷兰艾*** | 国省代码: | 荷兰;NL |
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摘要: | 本发明涉及一种用于处理受试者基因组数据的方法,包括:(a)获得受试者的基因组序列;(b)减小基因组序列信息的复杂性和/或量;以及(c)以可以迅速检索的形式存储步骤(b)的基因组序列信息。本发明还涉及一种方法,其中,通过剪切除与疾病或失调相关的特征数据之外的所述基因组序列信息,或者通过将受试者的基因组序列与包括与疾病或失调相关的特征数据的参考序列比对,来执行降低基因组序列信息的复杂性和/或量的步骤。此外,本发明涉及还涉及这样的方法,其中,包括使用受试者的功能遗传信息,尤其是基因表达数据;以及这样的方法,其中,将信息编码为矩阵并基于马尔可夫链过程对其进行解码和表示。也可以将获得的信息用于诊断、检测、监测或预后疾病和/或用于制备受试者的分子历史。此外,提供了相应的临床决策支持和存储系统,优选形式为电子图片/数据存档及通信系统。 | ||
搜索关键词: | 用于 处理 基因组 数据 方法 | ||
【主权项】:
一种用于处理受试者的基因组数据的方法,包括:(a)获得受试者的基因组序列;(b)减小基因组序列信息的复杂性和/或量;并且(c)以能够快速检索的形式存储步骤(b)的基因组序列信息。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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