[发明专利]一种基于特征kmer的异型性染色体序列组装方法及其应用有效
| 申请号： | 201210460704.8 | 申请日： | 2012-11-15 |
| 公开（公告）号： | CN103805689A | 公开（公告）日： | 2014-05-21 |
| 发明（设计）人： | 黄铨飞;李振宇;刘耿;刘兵行;王俊;汪建;杨焕明 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12M1/34 |
| 代理公司： | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人： | 祝莲君;雷芳 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于特征kmer的异型性染色体序列组装方法及其应用。具体地，本发明通过对同型（如XX或ZZ）样品和异型（如XY或者ZW）样品进行全基因组测序，并分析两种样品数据的kmer差异，获得异型性染色体的特征kmer；然后利用所述的特征kmer进行异型性染色体序列组装，从而得到异型性染色体的完整序列信息。本发明还提供了一种基于上述方法的组装单元。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 特征 kmer 异型 染色体 序列 组装 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
一种异型性染色体的序列组装方法，其特征在于，包括步骤：(1)分别对同型样品和异型样品进行全基因组测序，获得两种样本的测序数据和kmer数据；(2)比较步骤(1)的两种样品的kmer数据，获得异型性染色体的特征kmer；(3)根据步骤(2)的特征kmer，对异型性染色体进行组装，获得异型性染色体的组装序列。
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