[发明专利]二聚和三聚核酸染料以及相关的系统和方法有效

专利信息
申请号: 201210445877.2 申请日: 2006-03-17
公开(公告)号: CN102942566A 公开(公告)日: 2013-02-27
发明(设计)人: F·毛;W·-Y·里昂;X·辛 申请(专利权)人: 百奥提姆股份有限公司;阿莱罗杰克生物科学股份有限公司
主分类号: C07D417/14 分类号: C07D417/14;C07D219/08;C09B15/00;C09B23/10;C12Q1/68;G01N21/64
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 樊云飞
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 发明提供了二聚体和三聚体核酸染料以及有关的系统和方法。这种染料可形成发夹样结构,该结构使得所述染料通过(例如)请求式释放机理使核酸着色。例如,这种染料在没有核酸存在下的背景荧光低,在有核酸存在下,与核酸结合后的荧光高。本发明提供的染料可用于各种领域,例如实时PCR中的DNA定量测定。
搜索关键词: 三聚 核酸 染料 以及 相关 系统 方法
【主权项】:
1.一种具有下式的化合物:其中:Q1是荧光核酸染料成分;Q2是荧光核酸染料成分;Q1和Q2可以是相同或不同的;其中(i)Q1和Q2各自独立是具有式II所示结构的不对称花青染料:式II式II中,R1'是H;具有包括端点的1个碳-6个碳的烷基或烯基;卤素;-OR9;-SR10;-NR11R12;-CN;-NH(C=O)R13;-NHS(=O)2R14;-C(=O)NHR15;与小沟结合有关的取代基;或表示桥与该结构相连之处;当式II中的R1’包括R9、R10、R11、R12、R13、R14和R15中至少一个时,R9、R10、R11、R12、R13、R14和R15中任何一个所述基团独立为H;任选含有包括端点的1-2个氮且具有包括端点的1个碳-12个碳的烷基;或芳基;当式II中的R1’包括R11和R12时,R11和R12可组合形成5-或6-元饱和或不饱和环,该环可任选含有至少一个选自N和O的杂原子;式II中的X选自O和S;式II中的n选自0、1和2;式II中的R6是H;任选含有至少一个选自N、O和S的杂原子,具有包括端点的1个碳-10个碳的烷基或烯基;卤素;-OR16;-SR16;-NR16R17;任选含有包括端点的1-3个选自N、O和S的杂原子的取代或未取代芳基;或表示桥与该结构相连之处;式II中的R7是H;任选含有芳基和至少一个选自N、O和S的杂原子,具有包括端点的1个碳-10个碳的烷基或烯基;任选含有包括端点的1-3个选自N、O和S的杂原子的取代或未取代的芳基;或表示桥与该结构相连之处;式II中的R8和R8’组合形成稠合芳环,该芳环还可独立地用包括端点的C1-C2烷基、包括端点的C1-C2烷氧基、包括端点的C1-C2烷基巯基或卤素取代包括端点的1-4次;所述R16和R17各自独立为H;或任选含有1-2个氮,具有包括端点的1个碳-12个碳的烷基;或芳基;R16和R17可组合形成5-或6-元饱和或不饱和环,该环可任选含有至少一个选自N和O的杂原子;式II中的R1’、R6、和R7中只有一个表示桥与该结构相连之处;和式II中的Ψ是阴离子;或(ii)Q1和Q2各自独立地是具有式III的结构的吖啶染料:式III其中,式III中的各R1独立为H或包括端点的C1-C2烷基;式III中的R2和R3之一表示桥与该结构相连之处;当式III中的R2表示桥与该结构相连之处时,R3是H或-CH3;当式III中的R3表示桥与该结构相连之处时,R2选自H、-CH3、-NH2、-NHCH3、-CN和-C(=O)NH2;式III中的各R6独立为H或包括端点的C1-C2烷基;式III中的各R7独立为H或包括端点的C1-C2烷基;对于各对毗邻的R6或R7和R1,R6或R7和R1可独立组合形成5-或6-元饱和或不饱和环;和式III中的Ψ是阴离子;和桥是含有约8至约150个非氢原子的实质上脂族的接头,并且该接头包含不超过一个正电荷。
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