[发明专利]一种对基因序列片段进行拼接的系统和方法有效
申请号: | 201210291770.7 | 申请日: | 2012-08-16 |
公开(公告)号: | CN102867134A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 盛司潼 | 申请(专利权)人: | 盛司潼 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 518057 广东省深圳市南*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明涉及生物信息处理领域,提供了一种对基因序列片段进行拼接的系统,所述系统包括:数据库、过滤单元、拼接单元和处理单元;所述数据库用于存储基因序列片段;所述过滤单元用于对数据库中的基因序列片段中的短序列片段进行过滤,得长序列片段;所述拼接单元用于对长序列片段进行分段和拼接处理,得序列拼接图;所述处理单元用于对序列拼接图及图中的干扰因素进行去除处理并记录,得到序列信息。还提供了一种与对基因序列片段进行拼接的系统对应的方法。所述系统和方法能够提高序列片段拼接的准确度,从而为后续分析的准确性提供保障。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因 序列 片段 进行 拼接 系统 方法 | ||
【主权项】:
一种对基因序列片段进行拼接的系统,其特征在于,所述系统包括数据库、过滤单元、拼接单元和处理单元;所述数据库用于存储基因序列片段;所述过滤单元用于对数据库中的基因序列片段中的短序列片段进行过滤,得长序列片段;所述拼接单元用于对长序列片段进行分段和拼接处理,得序列拼接图;所述处理单元用于对序列拼接图及图中的干扰因素进行去除处理并记录,得到序列信息;所述处理单元中记录的信息包括对序列拼接图进行去除处理后的图的信息和图中被去除的信息。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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