[发明专利]一种建立核心种质研究群体的计算机模拟方法有效
| 申请号: | 201210270088.X | 申请日: | 2012-08-01 |
| 公开(公告)号: | CN102982228A | 公开(公告)日: | 2013-03-20 |
| 发明(设计)人: | 胡晋;王建成;关亚静;徐盛春 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
| 主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
| 代理公司: | 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 | 代理人: | 王雪 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: |
本发明提供一种建立核心种质研究群体的计算机模拟方法,包括以下步骤:田间小样本实际数据的获取,考察记录一系列田间数量性状数据;计算每个性状的均值M和标准差S;将实际群体个体数根据需要扩大为N倍,得到模拟群体初步规模;利用构造正态分布伪随机数方法,根据每个性状的标准差S,在计算机中模拟出性状数目和实际群体相同但大小为N的随机数群体,且均值为0,标准差为 |
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| 搜索关键词: | 一种 建立 核心 种质 研究 群体 计算机 模拟 方法 | ||
【主权项】:
1.一种建立核心种质研究群体的计算机模拟方法,包括以下步骤:(1)田间小样本实际数据的获取,将8~30个种质资源样品田间种植;考察记录一系列田间数量性状数据,考察的性状为8-15个;(2)基于田间小样本实际数据模拟核心种质研究群体包括以下步骤:1)计算每个性状的均值M和标准差S;2)将实际群体个体数根据需要扩大为N倍,得到模拟群体初步规模;3)利用常用的构造正态分布伪随机数方法,根据每个性状的标准差S,在计算机中模拟出性状数目和实际群体相同但大小为N的随机数群体,群体中每个性状均满足正态分布,且均值为0,标准差为
4)将随机化标准差群体每个个体均加上实际数据测得的对应性状均值M,得到初步模拟群体P;5)将该初步模拟群体P的个体随机删除n%,得到最终的模拟群体p。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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