[发明专利]长穗偃麦草基因组特异分子标记及其应用

摘要

本发明属于作物遗传育种领域，具体为根据NCBI公布的18srRNA基因的核苷酸序列，在两个RsaⅠ位点间序列设计引物，运用抑制消减杂交技术去除两个基因组DNA之间的同源序列,富集差异序列，获得长穗偃麦草特异的DNA片段并进行测序,依据与小麦无同源性的序列重新设计引物而获得长穗偃麦草基因组特异的分子标记36个。这些标记可用于长穗偃麦草向小麦转移染色体片段过程中的易位系鉴定,可用于抗赤霉病基因的连锁分析,可作为特异分子标记鉴定长穗偃麦草染色质而用于小麦抗赤霉病和抗逆性育种中。

主权项

一种长穗偃麦草基因组特异分子标记，它是下列36对引物之一：第1对：MEG‑1303L: 5’‑TGGATGGTGGCTGCTGAT‑3’R: 5’‑CCGTTATGCTGCCCGATT‑3’第2对：MEG‑1258L: 5’‑ACCAGCGGTAGCCCAGTCT‑3’R: 5’‑ATCTGTGCGATTTCCCTA‑3’第3对：MEG‑1253L: 5’‑CCAGCGGTAACCCAGTCT‑3’R: 5’‑AGTGCGATTTCCCTGACG‑3’第4对：MEG‑1211L: 5’‑GCTCATCAACAGCCTACC‑3’R: 5’‑TGTGACTTTCCCACCATT‑3’第5对：MEG‑1242L: 5’‑GAAAGGCTCCGAGAACAC‑3’R: 5’‑GTCAAAGGCTTAGCAATC‑3’第6对：MEG‑1177L: 5’‑TTGGGCTCAAGAACATTA‑3’R: 5’‑GGCAGGTACGACACCTAT‑3’第7对：MEG‑2301L: 5’‑TTGGGCTCAAGAACATTA‑3’R: 5’‑TGGAACGGATGAAGACCC‑3’第8对：MEG‑2249L: 5’‑GCCGACTCAGGAGGTGTT‑3’R: 5’‑TTGCATCCGTTGGTATTG‑3’第9对：MEG‑2304L: 5’‑TGTCCCACCATTGAGCAG‑3’R: 5’‑CCGGGCAGGTTAGACTATA‑3’第10对：MEG‑2237L: 5’‑CAGTGGCTTGTCAGAGTT‑3’R: 5’‑CGTAGCAGGATGGTTAGA‑3’第11对：MEG‑2422L: 5’‑GCTTGCGTCATCTCCTTC‑3’R: 5’‑TGATATGCCACTTCTCCTC‑3’第12对：MEG‑2407L: 5’‑TTAGTTAGGCAGTAGAGCA‑3’R: 5’‑CGACAAAGTAAGGTGGTG‑3’第13对：MEG‑2371L: 5’‑TGGGTAATGCCCGTCCTC‑3’R: 5’‑TCTGAATGTTTCCGCTTGT‑3’第14对：MEG‑3258L: 5’‑ATAGGGTTGCCAGTGAGGAG‑3’R: 5’‑GATTCATCATTTCCCATAGAG‑3’第15对：MEG‑3273L: 5’‑TTTACAAGGTGAAGGTCT‑3’R: 5’‑CATTGCGGACTATGATTT‑3’第16对：MEG‑3236L: 5’‑AGTGGCTTGTCAGAGTTG‑3’R: 5’‑CGTAGCAGGATGGTTAGA‑3’第17对：MEG‑3239L: 5’‑TGCGATTTCCCTGTCATT‑3’R: 5’‑TCCCAGCCAGATCAAGAG‑3’第18对：MEG‑3254L: 5’‑ATCTGTGCGATTTCCCTG‑3’R: 5’‑GCGGTAGCCAAGTCTGGT‑3’第19对：MEG‑3253L: 5’‑CCAGCGGTAACCCAGTCT‑3’R: 5’‑AGTGCGATTTCCCTGACG‑3’第20对：MEG‑3293L: 5’‑TGTTCACTCAGCCATCTC‑3’R: 5’‑ATCAACTTCAGCATCTTTA‑3’第21对：MEG‑3267L: 5’‑AGGGGCAACAAGGATAAG‑3’R: 5’‑TACACTACCGACGAGCAG‑3’第22对：MEG‑3367L: 5’‑ATGAGCCCAGTTGAGTTGTTT‑3’R: 5’‑TACTATGGTTGACCACCTAAAGAG‑3’第23对：MEG‑3211L: 5’‑GCTCATCAACAGCCTACC‑3’R: 5’‑TGTGACTTTCCCACCATT‑3’第24对：MEG‑4265L: 5’‑TAACGCCGACACTTAGGA‑3’R: 5’‑GGAAACCCAGGGACATCA‑3’第25对：MEG‑4253L: 5’‑CCTTGTGAGCCCAGTTAT‑3’R: 5’‑GCAGGTTCTTCCACCATTA‑3’第26对：MEG‑4268L: 5’‑GCTTGCGTCATCTCCTTC‑3’R: 5’‑TTCGGTCATAGTTGCTCTTC‑3’第27对：MEG‑4280L: 5’‑CCGTCTGTTACTCCATCG‑3’R: 5’‑CTCTGAAGCGGCGTCTGC‑3’第28对：MEG‑4353L: 5’‑CCTTGTGAGCCCAGTTAT‑3’R: 5’‑GCAGGTTCTTCCACCATTA‑3’第29对：MEG‑4483L: 5’‑ATCCCAATCTCAAATCAAG‑3’R: 5’‑TCAAATACTCAGCACGAAT‑3’第30对：MEG‑5350L: 5’‑CCCCAGGCAGAGGAACTA‑3’R: 5’‑CCCGGGCAGGTACATCTC‑3’第31对：MEG‑5385L: 5’‑CAATCTCGGAGCCATCAT‑3’R: 5’‑GGCCAGGTTCACATAAGG‑3’第32对：MEG‑5260L: 5’‑CATCTTCAGCGGTCTTGC‑3’R: 5’‑CGAGCGTGTTGGGTAAGT‑3’第33对：MEG‑5377L: 5’‑AAGTCAAGGCTGTCCCATA‑3’R: 5’‑ACTTTTCCCATGCTCACA‑3’第34对：MEG‑5254L: 5’‑ATTGAGCCTGCCGTAGAG‑3’R: 5’‑GTCATTGAGCGTATCCTGTT‑3’第35对：MEG‑5456L: 5’‑TCGCTGTCGTGCTTATCT‑3’R: 5’‑TGTATTTGGTGTTCCCTCC‑3’第36对：MEG‑5333L: 5’‑TTTGTGACGAAGAGGAGCAT‑3’R: 5’‑GCCCGTAGACAGGAGAAGT‑3’。