[发明专利]运用比较基因组学快速鉴定百脉根抗白粉病基因无效
申请号: | 201210095047.1 | 申请日: | 2012-03-31 |
公开(公告)号: | CN102703463A | 公开(公告)日: | 2012-10-03 |
发明(设计)人: | 钱孝英;俞锞;刘云飞 | 申请(专利权)人: | 常熟市支塘镇新盛技术咨询服务有限公司 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C07K14/415;C12Q1/68;A01H5/00 |
代理公司: | 苏州广正知识产权代理有限公司 32234 | 代理人: | 张利强 |
地址: | 215500 江苏省*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明是快速鉴定百脉根抗白粉病基因;涉及到植物比较基因组学,遗传学和生物信息学等学科知识,属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为:1)百脉根全基因组序列的下载及MLO型基因的采集;2)MLO型基因的鉴定;3)MLO型基因系统发育关系;4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了百脉根白粉病基因挖掘周期,有利于白粉病基因的快速鉴定;通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等),还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择,准确性高;结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制,缩短育种年限,提高育种效率;为阐述百脉根抗白粉病分子机制奠定了基础。 | ||
搜索关键词: | 运用 比较 基因组 快速 鉴定 百脉根抗 白粉病 基因 | ||
【主权项】:
百脉根抗白粉病基因,其特征在于选自下列1个基因:LjT40B16.20.r2.m氨基酸序列:MAKEDRVYERTLEETPTWAVAVVCFVLLAISIIIEHIIHAIGKWFKKKRKNALFEALEMVKGELMLMGFISLLLTVLQDPISKICISKSVASTWHPCANPKTKTKHDADSDSDDSNHRKLLEYFDLIPRRVLATKGYDKCHDKGKVALVSAYGIHQLHIFIFVLAIFHILQCIITLGLGRIKMRRWTRWEDETKTFEYQFYNDPERFRFARDTTFGRRHLSTWARSPVSLWIVSFLRQFYGSVTKVDYMALRHGFVMAHLAPGNDANFNFQKYINRSLEEDFKVVVGISPIIWFCAVLFLLTNAHGWYSYYWLPFIPLIIILLVGTKLQMIITMMGLRIQDRGEVIKGAPMVEPGDHLFWFNRPSLLLFLIHLVLFQNAFQLAFFSWSTYEFSLRSCFHEKNVDIIIRLTLGVVIQFLCSYVTLPLYALVTQMGSTLKPTIFNERVADALKKWHHTAKRQVKHSKHSEANSITPFSSRPATPTHGMSPVHLLHRHLAGRSDSVETSPRTSNYENEQWDVEGSNSPSNHPTGVDEIQLEVLEQRSEATELPITSTRHEISIAVSDFSFQKRHTGSD核苷酸序列:ATGGCTAAGGAAGACAGAGTTTATGAAAGAACTCTGGAAGAAACACCAACCTGGGCTGTTGCAGTTGTGTGCTTTGTGCTGCTTGCTATTTCAATCATAATTGAACATATTATTCATGCTATTGGAAAGTGGTTCAAAAAGAAGCGCAAAAATGCTCTTTTTGAAGCATTGGAAATGGTCAAAGGAGAGCTTATGCTGATGGGATTCATATCCTTGCTACTAACTGTGCTCCAAGATCCAATTTCTAAGATCTGTATATCAAAAAGTGTTGCATCCACTTGGCATCCTTGTGCCAATCCAAAGACAAAGACTAAACATGATGCAGATTCTGACAGTGATGATTCCAATCATAGGAAACTTCTCGAATATTTTGACCTCATTCCGCGGCGTGTTCTAGCTACAAAAGGATATGACAAGTGCCATGATAAGGGAAAAGTTGCCCTTGTTTCTGCATATGGGATCCACCAGCTCCACATATTTATTTTTGTGTTAGCTATTTTTCATATCCTACAATGCATTATAACACTTGGTTTGGGAAGGATTAAGATGAGACGCTGGACGAGATGGGAAGATGAAACAAAGACTTTTGAATATCAATTCTATAATGATCCTGAGAGGTTCAGATTTGCAAGGGACACAACATTTGGACGAAGGCACTTGAGCACGTGGGCTCGCTCACCAGTTTCCTTATGGATAGTTAGCTTCCTCAGACAATTCTATGGATCTGTTACTAAAGTTGATTACATGGCATTACGGCATGGATTTGTCATGGCACATCTAGCACCAGGAAACGATGCAAATTTCAATTTCCAGAAGTATATCAATAGATCACTAGAGGAGGATTTTAAAGTTGTGGTGGGAATAAGCCCTATTATATGGTTCTGTGCGGTGCTATTTCTGCTGACTAATGCTCATGGGTGGTATTCTTATTATTGGCTTCCATTTATCCCCTTAATTATAATCTTGCTAGTGGGTACTAAGCTACAAATGATCATAACAATGATGGGTTTGAGGATTCAAGACAGAGGTGAAGTAATCAAGGGTGCACCTATGGTTGAGCCAGGTGATCATCTGTTCTGGTTCAATCGTCCCAGCCTCCTTCTCTTTTTGATTCATCTTGTTCTCTTTCAGAATGCCTTTCAACTAGCTTTCTTTTCTTGGAGTACATATGAGTTCTCTCTAAGGTCATGCTTCCACGAAAAAAATGTGGATATTATCATTAGACTTACATTGGGGGTTGTAATACAATTCCTATGCAGCTATGTCACTTTGCCTCTTTATGCTCTAGTTACACAGATGGGTTCAACCTTGAAACCAACAATTTTCAATGAAAGAGTAGCAGATGCACTGAAGAAATGGCACCACACAGCCAAAAGGCAAGTCAAACACAGCAAGCATTCTGAGGCTAACAGCATCACACCATTCTCGAGCAGGCCAGCGACGCCAACGCACGGCATGTCTCCGGTTCACCTGCTGCACAGACACCTTGCCGGCCGCAGCGACAGTGTGGAAACTTCTCCGAGGACATCGAACTACGAGAATGAGCAGTGGGATGTTGAAGGCTCAAATTCTCCAAGTAACCACCCAACAGGAGTTGATGAGATACAGTTGGAAGTTTTGGAGCAACGTTCAGAAGCAACAGAATTGCCTATTACCAGCACTAGACATGAAATCAGCATTGCTGTATCCGATTTTTCTTTCCAGAAGCGACACACCGGTAGTGATTAG。
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