[发明专利]猪甘丙肽样肽基因GALP作为猪产仔数性状的遗传标记无效
申请号: | 201210039327.0 | 申请日: | 2012-02-21 |
公开(公告)号: | CN103255144A | 公开(公告)日: | 2013-08-21 |
发明(设计)人: | 李凤娥;苏丽娜;梅书棋;陶虎;李严;彭先文;蒋思文;邓昌彦;熊远著 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/11;C12Q1/68 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 张红兵 |
地址: | 430070 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明属于猪遗传标记制备与应用技术领域。具体涉及猪甘丙肽样肽GALP编码基因第2外显子的单核苷酸多态性(SNP)检测领域。其步骤包括:从猪血液中提取基因组DNA,设计引物,PCR扩增,PCR产物克隆、测序,序列比较分析,单核苷酸多态性检测,标记与产仔数性状间相关性分析。公开了猪GALP基因第3外显子的DNA序列和SNP分型的检测技术。本发明的遗传标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示,在上述序列的1157位bp处有一个碱基突变(C/G),并导致HhaI-RFLP多态性。本发明还公开了该遗传标记的制备方法及在猪产仔数标记辅助选择中的应用。 | ||
搜索关键词: | 猪甘丙肽样肽 基因 galp 作为 产仔 性状 遗传 标记 | ||
【主权项】:
一种猪产仔数性状的遗传标记,它是猪甘丙肽样肽基因GALP第3外显子的特异基因片段,它们的核苷酸序列如下所述SEQ ID NO.1梅山猪个体1GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGGATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAATGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCTCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACGGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCAGTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCATTGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGGTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性;SEQ ID NO.2梅山猪个体2GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGGATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAATGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCTCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACGGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCAGTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCAT TGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGGTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性;SEQ ID NO.3梅山猪个体3GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGAATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAATGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCCCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACCGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCAGTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCATTGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGCTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性;SEQ ID NO.4大白猪个体1GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGGATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAATGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCTCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACGGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCAGTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCAT TGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGGTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性;SEQ ID NO.5大白猪个体2GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGGATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAACGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCTCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACGGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCAGTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCATTGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGGTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性;SEQ ID NO.6大白猪个体3GTATTGAACCTGCGTCCTCATGGATGCTAGGCATGTTCTTTTCCACTGAGCCACAGTGGGAACTCCAAAGCAGTGGGGCTTTTTAAAAAAGCTTTCTGCCTTTAGAGGTCTTCAGTTTCCTCACTGGTGACGTTCAGATTAAGCAAAGCTGCTTCACAGACCAGCAGTTAAGTGGCATGCGGACCACGTCATCTCAGACCTGGGGGATGACCGCTAGCCTTTCTGTCTCTCTGAGCCTTGGTCTTTCCTTCTCTGTCCAGGGGCGAGGAGGCTGGACCCTCAACAGTGCTGGTTACCTCCTGGGTCCCGGTAAGTGAGCCTGTTCCGAGCACTTCCACCCTGGCTCCTACCTGCTTGGAGCCTGTGGGCAGTGAGTTTGCGACCCTGCAAAGACCCTCGAGCACATTCGCTGACGTCCACAGGTTTCACCAGGGTTAGGCTGGTGGAGTGACTGGCGCATGGATCCAGCAGCCAGAGCGTTGGGTTGAAGTCCCACTCTGACCCCCCGCTGGATATTCAACCTTTACGTCTCCACGCCTCCATTGCCTCGTCTGTGGCAATGGGTGTAGCGATGTCCACCCCCACCCCCACCCCGCCCCGCACAAGGTTGTTATGAGGATTAGATGACTTAGAGCAATTCTGGCATGTTCCTCCATCCATCTCTCTCCGTTCACTGCGTACTTGTGTCCGTAGTAGGGCGCTCTTTCCCTGCAGTTAAGGTTACGTGCCAGGACCCCTGCAATGCTACGGTTCGGAAGAGCTGGAGGGACGTGGGAATTGGATCTAGACAGTGGTGGCCTCGAACCCCAGTTCTGCTACTTAGCAGTGGGGTAACCTTGAGCCAAGGGCTCTACTTCTCGGAGCCTTGGGGTCCTCTCTGGGACATCAGGATGGTCGGTGTGCACCCCGCCCCTCCGCATTTGTTGGAGGTGCGCCACCAGGCGGATAGCGCCCTGGGGCTCTGGGCTGCTGGTTCTGTGTGTTCTCACTGCCTTTAATGACCAACTGGTCTTGCTCCCTCTCCTCACCCCTGCCCCCCA GTACTCCATCCGCCCTCCAGGGCTGAAGGAGGCGGGAAGGGGAAGACAGCCCTCGGGATCCTGGACCTGTGGAAGGCCATTGGTGAGTGAATCAGGAGTCTGACGGCCCTGTCCCTRCGCCGCAACGCTCCCCTCCACCTGCCCCTCGCTGGTGTTGGAAACTGGTGGGTGTGGGTTCCCACCCTTGTTCTGCACGTCCCAGATGGCGGAGCTTGAGCAACTTACTTCACATGCCTCCATGGGTAACACAGTCTCCTGAAAACCACCGCACAACGCGTGCAGTGAAAGCAGGTATGTACAATTCCTAGAAGGGAGGCTGGCATCTGGT上述序列中的R是C或G,导致HhaI‑RFLP多态性。
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