[发明专利]一种基于表达趋势的微小核糖核酸靶基因预测方法无效
| 申请号： | 201010572100.3 | 申请日： | 2010-12-03 |
| 公开（公告）号： | CN102485905A | 公开（公告）日： | 2012-06-06 |
| 发明（设计）人： | 陈喆;吴剑丙;刘培;潘辉;葛宇清 | 申请（专利权）人： | 浙江中医药大学附属第一医院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 310006*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明根据微小核糖核酸与靶基因的信使核糖核酸具有负相关的特点，从配对的微小核糖核酸与基因的信使核糖核酸的表达谱出发，找到了一种可行的表达趋势的微小核糖核酸靶基因预测的生物信息学方法，可直接针对微小核糖核酸的靶基因进行锁定，以便于进一步的生物学实验验证。本发明主要包括如下流程：步骤1：获取配对的微小核糖核酸与基因的信使核糖核酸的表达谱数据；步骤2：筛选显著变化的微小核糖核酸；步骤3：筛选显著变化的信使核糖核酸；步骤4：将显著变化的微小核糖核酸和显著变化的信使核糖核酸进行两两比较，计算相关系数；步骤5：对相关系数进行费希尔(Fisher)z变换；步骤6：t检验计算相关性的显著程度。最后筛选p＜0.01的信使核糖核酸为靶基因。最终，对于感兴趣的微小核糖核酸靶基因，可以直接进行实验验证。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 表达 趋势 微小 核糖核酸 基因 预测 方法 | ||
【主权项】：
本发明根据微小核糖核酸与靶基因的信使核糖核酸表达值具有负相关的特点，从配对的微小核糖核酸与基因的信使核糖核酸的表达谱出发，找到了一种可行的表达趋势的微小核糖核酸靶基因预测的生物信息学方法，可直接针对微小核糖核酸的靶基因进行锁定，以便于进一步的生物学实验验证。本发明主要包括如下流程：步骤1：获取配对的微小核糖核酸与基因的信使核糖核酸的表达谱数据；步骤2：筛选显著变化的微小核糖核酸；步骤3：筛选显著变化的信使核糖核酸；步骤4：将显著变化的微小核糖核酸和显著变化的信使核糖核酸进行两两比较，计算相关系数；步骤5：对相关系数进行费希尔(Fisher)z变换；步骤6：t检验计算相关性的显著程度。最后筛选p＜0.01的信使核糖核酸为靶基因。步骤7：对步骤六筛选的微小核糖核酸及靶基因，将靶基因克隆到荧光素酶载体中，微小核糖核酸前体与荧光素酶载体共同转染到人hela细胞系中。结果显示，报告基因的荧光素酶活性明显得到了抑制。说明这种靶基因预测是正确的。
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