[发明专利]从无基因组参考序列物种获得基因信息及功能基因的方法无效

专利信息
申请号: 201010197328.9 申请日: 2010-06-10
公开(公告)号: CN102277351A 公开(公告)日: 2011-12-14
发明(设计)人: 苗雪霞;李海超;王玉冰;张浩;黄勇平 申请(专利权)人: 中国科学院上海生命科学研究院
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/68
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陈静
地址: 20003*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明涉及从无基因组参考序列物种获得基因信息及功能基因的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的基因表达谱的方法。本发明还公开了获得亚洲玉米螟的转录组信息及功能基因的方法。本发明首次将DGE-tag技术与RNA-seq技术相结合,用于从无基因组参考序列的物种中获得基因的表达时期、表达量、对应的代谢通路及基因功能信息,所述方法方便、快捷、准确且成本低廉。
搜索关键词: 基因组 参考 序列 物种 获得 基因 信息 功能 方法
【主权项】:
一种从无基因组参考序列物种发掘基因信息的方法,包括:(1)获得待测物种的数字基因表达谱,其中包括基因表达标签的序列及丰度;(2)获得待测物种全基因组转录本的集合,形成序列数据库;(3)将(1)获得的数字基因表达谱中的基因表达标签分别与(2)获得的序列数据库进行比较,找到与该基因表达标签匹配的转录本序列,得到与该基因表达标签相应的基因全长cDNA序列,将该基因全长cDNA序列与已知基因信息的基因序列数据库进行比较和分析,获得该序列对应的基因的潜在功能;同时,根据(1)获得的该基因表达标签丰度获得其对应基因的表达量或表达模式。
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