[发明专利]染色体核苷酸序列图示作图法无效
申请号: | 200910197851.9 | 申请日: | 2009-10-29 |
公开(公告)号: | CN102054131A | 公开(公告)日: | 2011-05-11 |
发明(设计)人: | 郑大立 | 申请(专利权)人: | 郑大立 |
主分类号: | G06F19/26 | 分类号: | G06F19/26 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200060 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明是一种显示染色体上核苷酸序列方式,不同于常规使用的AGCT字符表达序列方式,是通过字符数值转化,先构建数值序列,并以此数值序列来制作二维或是三维图,来表达显示染色体上的核苷酸序列。序列图示化后使浏览查看整条染色体上的核苷酸分布特征成为现实。本发明还包含一套数学模型,通过对初始参数的设定,转换计算传统字符序列,成为数值序列。该数学模型既可计算用于二维绘图数据序列,也能计算产生用于三维绘图的数据序列。 | ||
搜索关键词: | 染色体 核苷酸 序列 图示 作图 | ||
【主权项】:
一种显示染色体核苷酸序列的方式,区别于常规染色体核苷酸字符序列的显示方式,染色体核苷酸序列图示法是将字符序列进行数值转换,成为数值序列,进而根据该数值序列来制作二维或三维染色体序列图的显示方式。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
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