[发明专利]一种判断蛋白质分子间生理属性相似性的方法无效
| 申请号： | 200710100354.3 | 申请日： | 2007-06-08 |
| 公开（公告）号： | CN101086503A | 公开（公告）日： | 2007-12-12 |
| 发明（设计）人： | 刘鑫;赵亚溥 | 申请（专利权）人： | 中国科学院力学研究所 |
| 主分类号： | G01N33/68 | 分类号： | G01N33/68;G06F17/00 |
| 代理公司： | 北京中创阳光知识产权代理有限责任公司 | 代理人： | 尹振启 |
| 地址： | 100080北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本申请公开一种判断蛋白质分子间生理属性相似性的方法，包括以下步骤：用已知的方法对蛋白质进行初选，得到初选的蛋白质序列段；将每条蛋白质序列段顺序划分为m字母字段链单元；再将m字母字段链单元中的每个字母作为一个顶点，并将任意两个顶点相连形成线段，计算各线段的疏水力；计算蛋白质组中所有i、j相同的线段的疏水力分别为1、0、－1的线段本底比例；计算线段比例；计算m字母字段链单元中各线段的权重，并得到每个蛋白质的平均权重和值S’n；将各蛋白质序列根据值S’n降序排列，最后得到蛋白质排列图，并以此判断出生理属性相似的蛋白质序列。根据本申请的方法判断蛋白质生理属性相似性，比传统方法简单，节约人力、财力，而且耗时短、效率高。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 判断 蛋白质 分子 生理 属性 相似性 方法 | ||
【主权项】：
1、一种判断蛋白质分子间生理属性相似性的方法，包括以下步骤：1)利用已知的传统序列比对方法对蛋白质进行初选，得到一组属性可能相近似的蛋白质组，并选取该组中的蛋白质分子序列段；2)每个蛋白质分子内部由氨基酸间复杂的疏水作用构成了一个蛋白质分子的疏水框架，计算上述各个蛋白质分子序列段的疏水框架相似性，进而，在相似的疏水框架上，各位点处残基可发生相应的改变，以此来判断蛋白质分子间生理属性相似性。
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