[发明专利]一种初步筛选次生代谢产物产生菌的方法无效
申请号: | 200510114891.4 | 申请日: | 2005-11-17 |
公开(公告)号: | CN1966717A | 公开(公告)日: | 2007-05-23 |
发明(设计)人: | 彭晶生 | 申请(专利权)人: | 彭晶生 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100871北京市海淀区成府路*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了初步筛选次生代谢产物产生菌的方法。该方法包括以下步骤:1)测定待筛选的菌种库中的每个菌株的核糖体小亚基RNA基因片段的序列;2)将目标次生代谢产物的已知产生菌,或在分子分类学上与所述目标次生代谢产物的已知产生菌是同一个分类阶元的菌株作为参照菌株;以所述参照菌株的核糖体小亚基RNA基因片段序列作为参照核糖体小亚基RNA基因片段序列;将所述参照核糖体小亚基RNA基因片段序列与步骤1)中的所述待筛选的菌种库中的菌株的核糖体小亚基RNA基因片段序列进行一对一的同源性比对,和所述参照核糖体小亚基RNA基因片段序列的同源性大于等于根据筛选通过率确定的同源性数值的菌株即为初筛的嫌疑菌株。 | ||
搜索关键词: | 一种 初步 筛选 次生 代谢 产物 产生 方法 | ||
【主权项】:
1、初步筛选次生代谢产物产生菌的方法,包括以下步骤:1)测定待筛选的菌种库中的每个菌株的核糖体小亚基RNA基因片段的序列;2)将目标次生代谢产物的已知产生菌,或在分子分类学上与所述目标次生代谢产物的已知产生菌是同一个分类阶元的菌株作为参照菌株;以所述参照菌株的核糖体小亚基RNA基因片段序列作为参照核糖体小亚基RNA基因片段序列;将所述参照核糖体小亚基RNA基因片段序列与步骤1)中的所述待筛选的菌种库中的菌株的核糖体小亚基RNA基因片段序列进行一对一的同源性比对,和所述参照核糖体小亚基RNA基因片段序列的同源性大于等于根据筛选通过率确定的同源性数值的菌株即为初筛的嫌疑菌株。
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